RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 MCFD2Q8NI22 146 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 TMED9Q9BVK6 235 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 HOXD1Q9GZZ0 328 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 RNF38Q9H0F5 515 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF639Q9UID6 485 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 CD79AP11912 226 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 FUT4P22083 530 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 IL4RP24394 825 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 E2F2Q14209 437 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 BEND4Q6ZU67 534 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 PEX13Q92968 403 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ELSPBP1Q96BH3 223 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 DTD2Q96FN9 168 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF382Q96SR6 550 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 PBX4Q9BYU1 374 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ISPDA4D126 451 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ARPC2O15144 300 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 AK1P00568 194 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 HRGP04196 525 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 SFTPDP35247 375 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 KIR2DS3Q14952 304 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 PM20D1Q6GTS8 502 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 TLDC1Q6P9B6 456 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 OR5B2Q96R09 309 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 MEMO1Q9Y316 297 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 PEPDP12955 493 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 GCH1P30793 250 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 PRKCDQ05655 676 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 EFR3AQ14156 821 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM53Q6P2H8 277 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 PGBD2Q6P3X8 592 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 SSX6Q7RTT6 188 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 PHF12Q96QT6 1004 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 IL4I1Q96RQ9 567 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 PARPBPQ9NWS1 579 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 SHISA7A6NL88 538 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 SOX14O95416 240 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 HSD3B1P14060 373 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 HSD3B2P26439 372 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 HMGCLP35914 325 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 FASLGP48023 281 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 SNU13P55769 128 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 GPX6P59796 221 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 DNAJB13P59910 316 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 DUSP6Q16828 381 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 NKAPLQ5M9Q1 402 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 NUP98P52948 1817 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 PRKD3O94806 890 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 SCGB1D2O95969 90 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 MAZP56270 477 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 TAS2R38P59533 333 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 CTBSQ01459 385 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 SLC6A18Q96N87 628 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM109Q9BVC6 243 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 MND1Q9BWT6 205 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 TBC1D24Q9ULP9 559 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 RAB26Q9ULW5 256 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 CCL26Q9Y258 94 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 TEX46H3BTG2 121 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 CEBPGP53567 150 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 E2F1Q01094 437 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 FOXC1Q12948 553 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 PLCZ1Q86YW0 608 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 SOX30O94993 753 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 BPNT1O95861 308 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 DHFRP00374 187 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 FESP07332 822 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 GLP1RP43220 463 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ABRAXAS2Q15018 415 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 FAM189A2Q15884 450 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 RGS21Q2M5E4 152 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ZFAND4Q86XD8 727 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 UBALD2Q8IYN6 164 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRB-204ENST00000538708 ZADH2Q8N4Q0 377 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.6 ms