RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 PLIN5Q00G26 463 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 LETMD1Q6P1Q0 360 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 RPTNQ6XPR3 784 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 OR2M7Q8NG81 312 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 OR4F6Q8NGB9 312 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 OR52N2Q8NGI0 321 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 AGAP11Q8TF27 550 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 FBXL20Q96IG2 436 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 HRH3Q9Y5N1 445 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 CACNA1DQ01668 2161 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 PCNX1Q96RV3 2341 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A1B0GTH9 108 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 PGRMC2O15173 223 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 RIPK2O43353 540 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 SEMA3DO95025 777 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 NADKO95544 446 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 CLPSP04118 112 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 COX7A2P14406 83 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ASPHQ12797 758 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 SGO1Q5FBB7 561 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 MTFR2Q6P444 385 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 CYP20A1Q6UW02 462 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 LYPD8Q6UX82 237 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 TIFABQ6ZNK6 161 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 NUDT13Q86X67 352 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 OR5L2Q8NGL0 311 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 SERPINI1Q99574 410 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 PLSCR2Q9NRY7 297 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 COPS7AQ9UBW8 275 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF225Q9UK10 706 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 LRBAP50851 2863 aa22.15■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 CSMD1Q96PZ7 3565 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 CCL3P10147 92 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 HERVK_113P63132 956 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 ERVK-8P63133 956 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 GGTA1PQ4G0N0 100 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 PIGGQ5H8A4 983 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 CEP112Q8N8E3 955 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 NUBPLQ8TB37 319 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 CNPPD1Q9BV87 410 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 ERVK-6Q9BXR3 956 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM216Q9P0N5 145 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 ERVK-19Q9WJR5 959 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 FBN2P35556 2912 aa22.14■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM166BA8MTA8 275 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 PDE9AO76083 593 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 KLK1P06870 262 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 MPEG1Q2M385 716 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 SPRED3Q2MJR0 410 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 RTL4Q6ZR62 310 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 MILR1Q7Z6M3 343 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 IFT20Q8IY31 132 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC34A3Q8N130 599 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 MARVELD3Q96A59 401 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 DMRTA2Q96SC8 542 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 DEFB127Q9H1M4 99 aa22.13■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 OR10H2O60403 315 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 GLSO94925 669 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 HTR1EP28566 365 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 PTGS2P35354 604 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 PPIAP62937 165 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 FOXO1Q12778 655 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 MMP21Q8N119 569 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 GOLM1Q8NBJ4 401 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 TTTY12Q9BZ98 90 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 SH2D2AQ9NP31 389 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 ABCA12Q86UK0 2595 aa22.12■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 PDYNP01213 254 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC35E2P0CK97 266 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 CNR1P21554 472 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 DNASE1L1P49184 302 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC37A1P57057 533 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 IFT88Q13099 833 aa22.11■■□□□ 1.13
PACSIN3-204ENST00000528201 BIKQ13323 160 aa22.11■■□□□ 1.13
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