RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524384.5

PTP4A2-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, human

TSL 5

Gene PTP4A2, Length 663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF597	Q96LX8	424 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	UBQLN3	Q9H347	655 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CNIH4	Q9P003	139 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	NENF	Q9UMX5	172 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	LIPT1	Q9Y234	373 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM234B	A2RU67	622 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	FRG2C	A6NGY1	282 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384		A6NHS1	94 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384		H0Y3Z8	333 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	GFY	I3L273	518 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR10H2	O60403	315 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	APOC2	P02655	101 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	IFNA16	P05015	189 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	SERPING1	P05155	500 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	SERPIND1	P05546	499 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	THBD	P07204	575 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CPN1	P15169	458 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	HNF1A	P20823	631 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	IMPA1	P29218	277 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	NAGLU	P54802	743 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	RAB8A	P61006	207 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	TBPL1	P62380	186 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	PRAME	P78395	509 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	MYL5	Q02045	173 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	SLC13A2	Q13183	592 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	KCNJ11	Q14654	390 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	EIPR1	Q53HC9	387 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	PIGG	Q5H8A4	983 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	C17orf64	Q86WR6	236 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM13C	Q8NE31	585 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM136A	Q96C01	138 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	STARD4	Q96DR4	205 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF778	Q96MU6	729 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CHODL	Q9H9P2	273 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR1F1	O43749	312 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	NRDC	O43847	1150 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	SSX4	O60224	188 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	NIPSNAP2	O75323	286 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	NDUFS3	O75489	264 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	ACTL6A	O96019	429 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	DANCR	P0C864	163 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CDH1	P12830	882 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CHM	P24386	653 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	HNF4A	P41235	474 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	KCNJ5	P48544	419 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CCZ1B	P86790	482 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	SRY	Q05066	204 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	RGS1	Q08116	209 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	TOMM20	Q15388	145 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	PARP6	Q2NL67	630 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	MIDN	Q504T8	468 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM166A	Q6J272	317 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	VWA1	Q6PCB0	445 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	BBS12	Q6ZW61	710 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTP4A2-208	ENST00000524384	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		7.36	□□□□□ -1.23

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