RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	CASP10	Q92851	521 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	OPTN	Q96CV9	577 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	APOL6	Q9BWW8	343 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	VCPKMT	Q9H867	229 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	PRO0461	Q9UI25	63 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	POMT2	Q9UKY4	750 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	TMCO1	Q9UM00	188 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	ALS2	Q96Q42	1657 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	RTL1	A6NKG5	1358 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	LRRC37A3	O60309	1634 aa		3.22	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		3.21	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		3.21	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		3.21	□□□□□ -1.89
COPS5-208	ENST00000519057	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	NFAT5	O94916	1531 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057		H3BQF6	201 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	TTI1	O43156	1089 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	PSMD10	O75832	226 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	THY1	P04216	161 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC166	P0CW27	439 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	NR2F1	P10589	423 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	MX1	P20591	662 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	SYT1	P21579	422 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	CCNC	P24863	283 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	SRPX	P78539	464 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	WASHC5	Q12768	1159 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	RALGDS	Q12967	914 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	FGD3	Q5JSP0	725 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	CFAP157	Q5JU67	520 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	FHL5	Q5TD97	284 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	GALNT17	Q6IS24	598 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	TLK2	Q86UE8	772 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	IQCH	Q86VS3	1027 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	MRAP	Q8TCY5	172 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	LRRC45	Q96CN5	670 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	NXPE2	Q96DL1	559 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	FUT8	Q9BYC5	575 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	DRC3	Q9H069	523 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	VCX	Q9H320	206 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	PARVB	Q9HBI1	364 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	COMMD8	Q9NX08	183 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	KLK11	Q9UBX7	282 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	MSH6	P52701	1360 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		3.21	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	SLIT3	O75094	1523 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	ABCA3	Q99758	1704 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF749	O43361	778 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	CYTH3	O43739	400 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	TADA2A	O75478	443 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	KRT14	P02533	472 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	OR52Z1	P0C646	297 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	S100A1	P23297	94 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	FNTA	P49354	379 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	CACNG1	Q06432	222 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		3.2	□□□□□ -1.9
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		3.2	□□□□□ -1.9

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