RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 CCL3P10147 92 aa17.79■□□□□ 0.44
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SH3BP2-220ENST00000511663 H0YIV9 168 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP2-220ENST00000511663 TP53I11O14683 189 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP2-220ENST00000511663 C2P06681 752 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP2-220ENST00000511663 CELA3AP09093 270 aa17.75■□□□□ 0.43
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SH3BP2-220ENST00000511663 TYK2P29597 1187 aa17.75■□□□□ 0.43
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