RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	SMIM6	P0DI80	62 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	CBSL	P0DN79	551 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	MTHFD2	P13995	350 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMC3	P17980	439 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	RCVRN	P35243	200 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	CBS	P35520	551 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ARL4A	P40617	200 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	SLCO1A2	P46721	670 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNJ1	P48048	391 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	MTNR1B	P49286	362 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	GLUD2	P49448	558 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	NUP107	P57740	925 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTB	P60709	375 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTA2	P62736	377 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTG1	P63261	375 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTG2	P63267	376 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTC1	P68032	377 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ACTA1	P68133	377 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	DEFB103A	P81534	67 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	CHRNB3	Q05901	458 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC3A1	Q07837	685 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	KRT81	Q14533	505 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	HNF4G	Q14541	408 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF273	Q14593	569 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	IRF3	Q14653	427 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMD5	Q16401	504 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB6C	Q53S08	254 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	CHST9	Q7L1S5	443 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	SCD5	Q86SK9	330 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKRD46	Q86W74	232 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	MICU2	Q8IYU8	434 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	PQLC3	Q8N755	202 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ACBD4	Q8NC06	268 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMG2	Q969U7	264 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	RTP4	Q96DX8	246 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	SGTB	Q96EQ0	304 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	C5orf34	Q96MH7	638 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF145	Q96MT1	663 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	SGPP1	Q9BX95	441 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	CHODL	Q9H9P2	273 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	NMUR1	Q9HB89	426 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	OXSM	Q9NWU1	459 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	C3orf18	Q9UK00	162 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	INSL6	Q9Y581	213 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	HTT	P42858	3142 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1B0GUH1	482 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR27	A2RRH5	827 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971		A6NIZ1	184 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	CLCA1	A8K7I4	914 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	HACD1	B0YJ81	288 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	C22orf46	C9J442	243 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC22A2	O15244	555 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	CHP2	O43745	196 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	GJB5	O95377	273 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	LINC00271	P0C7V0	271 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	CEBPB	P17676	345 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	LBP	P18428	481 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	ATP6V1C1	P21283	382 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	CASR	P41180	1078 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	MC3R	P41968	323 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	GRIA2	P42262	883 aa		6.43	□□□□□ -1.38
FBXO38-208	ENST00000504971	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38

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