RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 AGR3Q8TD06 166 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ELP5Q8TE02 316 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 C16orf78Q8WTQ4 265 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 RIT1Q92963 219 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 TUBGCP3Q96CW5 907 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 MTERF3Q96E29 417 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 C19orf60Q96EN9 201 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 NUDT9Q9BW91 350 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ENTPD4Q9Y227 616 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CFL2Q9Y281 166 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 CCL27Q9Y4X3 112 aa13.6□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2W5A6NFC9 320 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 OR6C76A6NM76 312 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 LSM1O15116 133 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 DDCP20711 480 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ALDH9A1P49189 494 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 C2orf80Q0P641 193 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 C19orf57Q0VDD7 668 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 LY6DQ14210 128 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 KIAA0040Q15053 153 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 SPRED3Q2MJR0 410 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 XKR7Q5GH72 579 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 Q6ZSR9 355 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF781Q8N8C0 355 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 OR1N1Q8NGS0 311 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 KLHL29Q96CT2 875 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ERP27Q96DN0 273 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 FCRL1Q96LA6 429 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 TUBB1Q9H4B7 451 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 TAS2R7Q9NYW3 318 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 STMN3Q9NZ72 180 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 UTS2RQ9UKP6 389 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 NUP210LQ5VU65 1888 aa13.59□□□□□ -0.23
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM208BQ5VWN6 2430 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 GLOD5A6NK44 160 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 A8MUA0 341 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 A8MUI8 341 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 PGRMC2O15173 223 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 HDAC3O15379 428 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 ITM2AO43736 263 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 SNNO75324 88 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 ATP1B1P05026 303 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 IL3P08700 152 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 CPMP14384 443 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 NR1D1P20393 614 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 NTSP30990 170 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 HPCAL1P37235 193 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 EFNA3P52797 238 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 RPL38P63173 70 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 RAE1P78406 368 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 EMX2Q04743 252 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 Q0VFX4 171 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 TLR1Q15399 786 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 GALNTL6Q49A17 601 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 GALNT12Q8IXK2 581 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 FNDC5Q8NAU1 212 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 OR7G1Q8NGA0 311 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 HAS2Q92819 552 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB9Q96C00 473 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXL20Q96IG2 436 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 C7orf26Q96N11 449 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 SEMA4CQ9C0C4 833 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 ATAD3AQ9NVI7 634 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 PTGFRNQ9P2B2 879 aa13.58□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 TBX19O60806 448 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 PEX11AO75192 247 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 ITGAMP11215 1152 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 NT5EP21589 574 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 SOX11P35716 441 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 ERVK-8P63133 956 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 PSPHP78330 225 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 ARG2P78540 354 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 ACER2Q5QJU3 275 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 C6orf136Q5SQH8 315 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM71E1Q6IPT2 247 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 PCSK4Q6UW60 755 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC29A4Q7RTT9 530 aa13.57□□□□□ -0.24
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4N5Q8IXE1 308 aa13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms