RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 CHSY3Q70JA7 882 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 CPNE9Q8IYJ1 553 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 OR5T3Q8NGG3 340 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 NEIL2Q969S2 332 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 MFSD3Q96ES6 412 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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PDE4D-210ENST00000503258 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 SAYSD1Q9NPB0 183 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ABCG2Q9UNQ0 655 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 HIVEP1P15822 2718 aa7.05□□□□□ -1.28
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PDE4D-210ENST00000503258 C4orf51C9J302 202 aa7.05□□□□□ -1.28
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PDE4D-210ENST00000503258 NPIPA3F8WFD2 350 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 CSF3P09919 207 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 CCL3P10147 92 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 MAOAP21397 527 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 DRD5P21918 477 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 NAB1Q13506 487 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.281e-8■■■■■ 39.3
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PDE4D-210ENST00000503258 ZNF470Q6ECI4 717 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 DEF8Q6ZN54 512 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 SLC29A4Q7RTT9 530 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ADCK2Q7Z695 626 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ELOA3Q8NG57 546 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 RHBDF1Q96CC6 855 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 CMTM7Q96FZ5 175 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.05□□□□□ -1.28
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PDE4D-210ENST00000503258 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 FBXW2Q9UKT8 454 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.05□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 CBR3O75828 277 aa7.04□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 FCGR2AP12318 317 aa7.04□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 MAP4K2Q12851 820 aa7.04□□□□□ -1.28
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PDE4D-210ENST00000503258 FNDC7Q5VTL7 733 aa7.04□□□□□ -1.28
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PDE4D-210ENST00000503258 ZNF675Q8TD23 568 aa7.04□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.04□□□□□ -1.28
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PDE4D-210ENST00000503258 REPS1Q96D71 796 aa7.04□□□□□ -1.28
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PDE4D-210ENST00000503258 CXorf56Q9H5V9 222 aa7.04□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 LDAHQ9H6V9 325 aa7.04□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 AP4B1Q9Y6B7 739 aa7.04□□□□□ -1.28
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PDE4D-210ENST00000503258 CYP4B1P13584 511 aa7.04□□□□□ -1.28
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PDE4D-210ENST00000503258 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.04□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 DGAT2Q96PD7 388 aa7.04□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 MDFIQ99750 246 aa7.04□□□□□ -1.28
PDE4D-210ENST00000503258 ACAT2Q9BWD1 397 aa7.04□□□□□ -1.28
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