RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 RDH11Q8TC12 318 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ART5Q96L15 291 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 NDE1Q9NXR1 346 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 FAM205AQ6ZU69 1335 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM89A2RUT3 159 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 GRID2O43424 1007 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 IGKV3-20P01619 116 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A8P48029 635 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM50BP56557 158 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 MYBPC1Q00872 1141 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 P2RY14Q15391 338 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL22Q53GT1 634 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 LIPJQ5W064 366 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 WDR49Q8IV35 697 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 METTL4Q8N3J2 472 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 AURKCQ9UQB9 309 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 RGSL1A5PLK6 1076 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 MEI4A8MW99 385 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 NXPH4O95158 308 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 FCER2P06734 321 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 PRDX6P30041 224 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEA4P43358 317 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 PMP22Q01453 160 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 PDIA5Q14554 519 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 UPP1Q16831 310 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ITIH5Q86UX2 942 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 SPPL2AQ8TCT8 520 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 PHYHIPQ92561 330 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 P3H4Q92791 437 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM45BQ96B21 275 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ATP8B3O60423 1300 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 KIF7Q2M1P5 1343 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01565O15544 149 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN2O60636 221 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 FHP07954 510 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 GP9P14770 177 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TMOD1P28289 359 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 SPP2Q13103 211 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 NEPROQ6NW34 567 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 MLKLQ8NB16 471 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf58Q96GQ5 468 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 COG3Q96JB2 828 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 AGAP4Q96P64 663 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 LGMNQ99538 433 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 LHX3Q9UBR4 397 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 IL20RAQ9UHF4 553 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 G3V2L1 256 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF131P52739 623 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 NDST1P52848 882 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 AGKQ53H12 422 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 DCAF12Q5T6F0 453 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 FCGR1BQ92637 280 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 PTPRUQ92729 1446 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WYN8 130 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 BUB1O43683 1085 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 AKR7A3O95154 331 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM49P0CI25 452 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM49CP0CI26 452 aa6.45□□□□□ -1.38
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