RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490540.1

ASIC3-208, Transcript of acid sensing ion channel subunit 3, human

TSL 2

Gene ASIC3, Length 520 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC3-208	ENST00000490540	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PHF11	Q9UIL8	331 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PCTP	Q9UKL6	214 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ASB4	Q9Y574	426 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		11.1	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CCDC189	A1A4V9	331 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PROM1	O43490	865 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CLDN9	O95484	217 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	IGKV3-11	P04433	115 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	TPO	P07202	933 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CCL3	P10147	92 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	NR2F6	P10588	404 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	COX7A2	P14406	83 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PTGS2	P35354	604 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	DNASE1L1	P49184	302 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SERPINB9	P50453	376 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CCNG1	P51959	295 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	HERVK_113	P63132	956 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ERVK-8	P63133	956 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PHEX	P78562	749 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PLIN5	Q00G26	463 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PLGLB1	Q02325	96 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	TRAF3	Q13114	568 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	TESK1	Q15569	626 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SGO1	Q5FBB7	561 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	RTL4	Q6ZR62	310 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	NUDT13	Q86X67	352 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CEP112	Q8N8E3	955 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	REPS1	Q96D71	796 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	NFU1	Q9UMS0	254 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	TACC2	O95359	2948 aa		11.08	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	NF1	P21359	2839 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540		A8MT66	165 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	PPP6C	O00743	305 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	STX16	O14662	325 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	PRRG2	O14669	202 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	PGRMC2	O15173	223 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	OR10H2	O60403	315 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	UGDH	O60701	494 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	SMIM24	O75264	130 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	LRAT	O95237	230 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	CLDN14	O95500	239 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	GPR75	O95800	540 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	RBP1	P09455	135 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	SBK3	P0C264	359 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	GCA	P28676	217 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	TLE4	Q04727	773 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	CUL3	Q13618	768 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	RPRML	Q8N4K4	120 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	OR8K3	Q8NH51	312 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	TANK	Q92844	425 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	FBXL20	Q96IG2	436 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	PPT2	Q9UMR5	302 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	ZFHX3	Q15911	3703 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	SCN2A	Q99250	2005 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		11.07	□□□□□ -0.64
ASIC3-208	ENST00000490540		E9PLN8	166 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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