RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NOBOX	O60393	691 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC9A3	P48764	834 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	OGDH	Q02218	1023 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TLE3	Q04726	772 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	RGS1	Q08116	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SMPDL3A	Q92484	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	UBE2E3	Q969T4	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	S100PBP	Q96BU1	408 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	C5orf34	Q96MH7	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	FGF21	Q9NSA1	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261		B8ZZF3	427 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261		H3BML4	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SMLR1	H3BR10	107 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	EFS	O43281	561 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	B4GAT1	O43505	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	RNF13	O43567	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SCRG1	O75711	98 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CHEK2	O96017	543 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	APRT	P07741	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TUBG1	P23258	451 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CDKN2B	P42772	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CAPZB	P47756	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TAS2R40	P59535	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TUBB4B	P68371	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	IRF9	Q00978	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF573	Q86YE8	665 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	OR4L1	Q8NH43	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	RAB33B	Q9H082	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	MLX	Q9UH92	298 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TSC2	P49815	1807 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CLPX	O76031	633 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	MGAT5	Q09328	741 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	RBBP8	Q99708	897 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	VCX	Q9H320	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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