RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFAF4Q9P032 175 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa15.46■□□□□ 0.07
CCSAP-204ENST00000483092 ACRP10323 421 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 HLA-EP13747 358 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.068e-9■■□□□ 11.4
CCSAP-204ENST00000483092 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.063e-9■■■■□ 20.7
CCSAP-204ENST00000483092 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 PIGKQ92643 395 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CD244Q9BZW8 370 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 NUDT15Q9NV35 164 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 INSL5Q9Y5Q6 135 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 HKDC1Q2TB90 917 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM145Q8NBT3 493 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 NFKBIDQ8NI38 313 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SCAMP4Q969E2 229 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 P2RY12Q9H244 342 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CHD5Q8TDI0 1954 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 OR2AG2A6NM03 316 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 DHFRP00374 187 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 ICAM2P13598 275 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 HIST1H2ADP20671 130 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CHMP24386 653 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 MTFR2Q6P444 385 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CREB3L4Q8TEY5 395 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SORCS1Q8WY21 1168 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM80Q96HE8 168 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SIGLEC11Q96RL6 698 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 HIST1H2AJQ99878 128 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 H2AFJQ9BTM1 129 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 TSSK6Q9BXA6 273 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SNX11Q9Y5W9 270 aa15.45■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 PRR23AA6NEV1 266 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 DGKAP23743 735 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 HLA-DMAP28067 261 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 MAPK1P28482 360 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 RPIAP49247 311 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 FRMPD2BQ6IN97 320 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 NOXRED1Q6NXP6 359 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 TEX261Q6UWH6 196 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 DEF8Q6ZN54 512 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 PTOV1Q86YD1 416 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 OR4A15Q8NGL6 344 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 AP3S1Q92572 193 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 FBXW5Q969U6 566 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 ABCG5Q9H222 651 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CWH43Q9H720 699 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 U3KQ87 197 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 ANXA5P08758 320 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 NR2F6P10588 404 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM65Q6PI78 240 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 BRAT1Q6PJG6 821 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 FAM92BQ6ZTR7 304 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 GAREM2Q75VX8 874 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SLC30A4O14863 429 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SCG5P05408 212 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 LHCGRP22888 699 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 RPL35P42766 123 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CRISP1P54107 249 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 PER3P56645 1201 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 MICAQ29983 383 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 IDNKQ5T6J7 187 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 Q6ZVU0 165 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF558Q96NG5 402 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM175Q9BSA9 504 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 DUSP26Q9BV47 211 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SLC28A3Q9HAS3 691 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CCL26Q9Y258 94 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 SLC22A14Q9Y267 594 aa15.44■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 CCL16O15467 120 aa15.43■□□□□ 0.06
CCSAP-204ENST00000483092 GASTP01350 101 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms