RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479397.2

CNOT10-215, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 5

Gene CNOT10, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-215	ENST00000479397	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	NUBPL	Q8TB37	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	NT5C	Q8TCD5	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	PEX13	Q92968	403 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	UBQLN3	Q9H347	655 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	PROK2	Q9HC23	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	FETUB	Q9UGM5	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397		A0A088AWK7	358 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397		E5RI56	91 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	TP53I11	O14683	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	PSTPIP1	O43586	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	DYRK3	O43781	588 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	SPOP	O43791	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	CDH16	O75309	829 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	B3GALT4	O96024	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	SERPINC1	P01008	464 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	SOD3	P08294	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	DANCR	P0C864	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	RBP3	P10745	1247 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	COX7A2	P14406	83 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	TNNI3	P19429	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	ADRA1D	P25100	572 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	DPP4	P27487	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	IMPA1	P29218	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	AHR	P35869	848 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	SLC6A12	P48065	614 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	CCR8	P51685	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	NAGLU	P54802	743 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	RAB8A	P61006	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	ACVR1	Q04771	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	SRY	Q05066	204 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	STX4	Q12846	297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	CDH17	Q12864	832 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	FAP	Q12884	760 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	CA13	Q8N1Q1	262 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	TRPV3	Q8NET8	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	DIO2	Q92813	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	C1orf159	Q96HA4	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	FAR2	Q96K12	515 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CNOT10-215	ENST00000479397	FANCF	Q9NPI8	374 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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