RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473584.1

SCP2-208, Transcript of sterol carrier protein 2, human

TSL 2

Gene SCP2, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCP2-208	ENST00000473584	TMEM45B	Q96B21	275 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCP2-208	ENST00000473584	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCP2-208	ENST00000473584	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCP2-208	ENST00000473584	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCP2-208	ENST00000473584	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCP2-208	ENST00000473584	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SCP2-208	ENST00000473584	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	MEI4	A8MW99	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	AMBP	P02760	352 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	PDHA2	P29803	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	PRDX6	P30041	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	PPP2R1A	P30153	589 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	NDST2	P52849	883 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	CEBPE	Q15744	281 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	AGK	Q53H12	422 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	CERS5	Q8N5B7	392 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	OR5H15	A6NDH6	313 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584		F8WDY8	70 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	CPLX1	O14810	134 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	CFLAR	O15519	480 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	CLDN3	O15551	220 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	CS	O75390	466 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	SCGB2A1	O75556	95 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	CALCA	P01258	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	FCER2	P06734	321 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	GP9	P14770	177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	AOC1	P19801	751 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	MATK	P42679	507 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	NDST1	P52848	882 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	MTTP	P55157	894 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	SPP2	Q13103	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	P2RY14	Q15391	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	HAGH	Q16775	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	UPP1	Q16831	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584		Q6ZRP5	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	ITIH5	Q86UX2	942 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	COG3	Q96JB2	828 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	LITAF	Q99732	161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	LHX3	Q9UBR4	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	LGALS8	O00214	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	TSPAN2	O60636	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	IFNB1	P01574	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	KIF5B	P33176	963 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	NPY2R	P49146	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	TKTL1	P51854	596 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	RIG	Q13278	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SCP2-208	ENST00000473584	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68

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