RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 GSTO2Q9H4Y5 243 aa22.28■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 MYOTQ9UBF9 498 aa22.28■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM200CA6NKL6 621 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 WWP2O00308 870 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 PGRMC2O15173 223 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 NME2P1O60361 137 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 ULK1O75385 1050 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 OR2J2O76002 312 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 NUDT17P0C025 328 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 NME2P22392 152 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 RNF4P78317 190 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 IFFO1Q0D2I5 559 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 WDR93Q6P2C0 686 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 EMBQ6PCB8 327 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 GFRALQ6UXV0 394 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 OR5L2Q8NGL0 311 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 OR8K3Q8NH51 312 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 VPS29Q9UBQ0 182 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 SLC5A6Q9Y289 635 aa22.27■■□□□ 1.16
SMKR1-201ENST00000462322 ESPNB1AK53 854 aa22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ENO1P06733 434 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 HSD3B1P14060 373 aa22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 HSD3B2P26439 372 aa22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 HK2P52789 917 aa22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 KCNK10P57789 538 aa22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 RDH11Q8TC12 318 aa22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 DOK4Q8TEW6 326 aa22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ASB15Q8WXK1 588 aa22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ART5Q96L15 291 aa22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 MID1IP1Q9NPA3 183 aa22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 SEC14L3Q9UDX4 400 aa22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ERVK-11Q9UQG0 969 aa22.26■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC151A5D8V7 595 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ASPDHA6ND91 283 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 GUCY1B2O75343 617 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 UNC5CO95185 931 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ESRRBO95718 433 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 CPA3P15088 417 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 PIK3R1P27986 724 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 NAGLUP54802 743 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 NAA20P61599 178 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 SLC18A2Q05940 514 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 CFAP157Q5JU67 520 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 AGAP11Q8TF27 550 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 RIT1Q92963 219 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 FBXL20Q96IG2 436 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 FRMD6Q96NE9 622 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 RASL10BQ96S79 203 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 CNPPD1Q9BV87 410 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 TIMM22Q9Y584 194 aa22.25■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 A8MVJ9 347 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 HRKO00198 91 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 IGKV3-11P04433 115 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 SLC35E2P0CK97 266 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 CHN1P15882 459 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 HTR6P50406 440 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 DNAJB13P59910 316 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ERVK-8P63133 956 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 OR4K14Q8NGD5 310 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 CAVIN3Q969G5 261 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 KCNA7Q96RP8 456 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 OXSMQ9NWU1 459 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 HPF1Q9NWY4 346 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ERVK-19Q9WJR5 959 aa22.24■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 OR6B1O95007 311 aa22.23■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 SOX3P41225 446 aa22.23■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 SPRED3Q2MJR0 410 aa22.23■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.23■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 IL20RBQ6UXL0 311 aa22.23■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 FRMD7Q6ZUT3 714 aa22.23■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 MDGA2Q7Z553 956 aa22.23■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 CHTF18Q8WVB6 975 aa22.23■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 ACPTQ9BZG2 426 aa22.23■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 MID2Q9UJV3 735 aa22.23■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa22.23■■□□□ 1.15
SMKR1-201ENST00000462322 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms