RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 ME3Q16798 604 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 GTDC1Q4AE62 458 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SYTL3Q4VX76 610 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TEX44Q53QW1 395 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM205Q6UW68 189 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 UNC5DQ6UXZ4 953 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SLC36A4Q6YBV0 504 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 LPCAT2Q7L5N7 544 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF354CQ86Y25 554 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 FAM219AQ8IW50 185 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CKAP2LQ8IYA6 745 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 PM20D2Q8IYS1 436 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 GCNT2Q8N0V5 402 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF619Q8N2I2 560 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 HORMAD2Q8N7B1 307 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 LRRC75AQ8NAA5 344 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF740Q8NDX6 193 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TSPEARQ8WU66 669 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TSKUQ8WUA8 353 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CHAC2Q8WUX2 184 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ELSPBP1Q96BH3 223 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ANAPC16Q96DE5 110 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 LRRC46Q96FV0 321 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SMARCD1Q96GM5 515 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MAGED4Q96JG8 741 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MAP3K3Q99759 626 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MXRA8Q9BRK3 442 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 OVOL2Q9BRP0 275 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 FUZQ9BT04 418 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ADI1Q9BV57 179 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MTMR12Q9C0I1 747 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 RAD21L1Q9H4I0 556 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 RABEP2Q9H5N1 569 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SMYD3Q9H7B4 428 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CABP5Q9NP86 173 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SPTLC3Q9NUV7 552 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 OXSMQ9NWU1 459 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ACTR10Q9NZ32 417 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 LUZP4Q9P127 313 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF212Q9UDV6 495 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SATB2Q9UPW6 733 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 JRKLQ9Y4A0 524 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 DGKBQ9Y6T7 804 aa-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 PRXQ9BXM0 1461 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 A0A087WTM6 91 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MUC21A0A140T8X8 626 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TMEM150BA6NC51 233 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 ASB14A6NK59 587 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 DUXAA6NLW8 204 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CLCA1A8K7I4 914 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MAGEB17A8MXT2 336 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 E2F3O00716 465 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CHUKO15111 745 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 INPP4BO15327 924 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 EEDO75530 441 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 JRKO75564 520 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TRMUO75648 421 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TNFSF15O95150 251 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 EML2O95834 649 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 FAM228BP0C875 321 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MYZAPP0CAP1 466 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 GIFP27352 417 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 LMAN1P49257 510 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 PRKAG1P54619 331 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 FOXA1P55317 472 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 CTBP2P56545 445 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 PPIAP62937 165 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 KCNJ10P78508 379 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 SCRN3Q0VDG4 424 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MGAT2Q10469 447 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 GALNT3Q14435 633 aa-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 OASLQ15646 514 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SNORD57-201ENST00000448188 MAPK14Q16539 360 aa-0.83□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.5 ms