RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 EXO5Q9H790 373 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF665Q9H7R5 613 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PELI2Q9HAT8 420 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC52A3Q9NQ40 469 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 OR6C2Q9NZP2 312 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF319Q9P2F9 582 aa4.23□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 OR1A2Q9Y585 309 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SHANK2Q9UPX8 1470 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 VWDEQ8N2E2 1590 aa4.23□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 NEURL4Q96JN8 1562 aa4.23□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 LINC01553A4QN01 128 aa4.22□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 A8MVM7 634 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 INAFM1C9JVW0 142 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 NPIPA2E9PIF3 369 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 OVOL3O00110 214 aa4.22□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF264O43296 627 aa4.22□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 JAK2O60674 1132 aa4.22□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 BBOX1O75936 387 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ANP32DO95626 131 aa4.22□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 SLC2A3P11169 496 aa4.22□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 CAPGP40121 348 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 RFX2P48378 723 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PRMT2P55345 433 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PROK1P58294 105 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 RPS8P62241 208 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 HERVK_113P63132 956 aa4.22□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 MYL7Q01449 175 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 HYAL1Q12794 435 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 DRP2Q13474 957 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT81Q14533 505 aa4.22□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 DPYSL2Q16555 572 aa4.22□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 LRIT3Q3SXY7 679 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM65Q6PJ69 517 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF788Q6ZQV5 615 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF627Q7L945 461 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 C5orf24Q7Z6I8 188 aa4.22□□□□□ -1.73
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CBX1P4-201ENST00000439415 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 MLKLQ8NB16 471 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 DDHD1Q8NEL9 900 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC35C1Q96A29 364 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SCMH1Q96GD3 660 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 C4orf45Q96LM5 186 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 NPAS2Q99743 824 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC39A3Q9BRY0 314 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ERVK-6Q9BXR3 956 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 GSDMCQ9BYG8 508 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2B2Q9GZK3 357 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PRSS22Q9GZN4 317 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 EVA1AQ9H8M9 152 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 MED20Q9H944 212 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 MEAF6Q9HAF1 191 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXL4Q9UKA2 621 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PILRBQ9UKJ0 227 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNS2Q9ULS6 477 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ARID2Q68CP9 1835 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP10AO60312 1499 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP4.22□□□□□ -1.73
CBX1P4-201ENST00000439415 CEP350Q5VT06 3117 aa4.21□□□□□ -1.73
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