RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435165.2

SGIP1-206, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-206ENST00000435165 MLF1P58340 268 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 RPS16P62249 146 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 GNGT1P63211 74 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 CCZ1BP86790 482 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 GABPAQ06546 454 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 SERTAD2Q14140 314 aa3.59□□□□□ -1.83
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SGIP1-206ENST00000435165 SLC35D3Q5M8T2 416 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 ZNF618Q5T7W0 954 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 ABHD17BQ5VST6 288 aa3.59□□□□□ -1.83
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SGIP1-206ENST00000435165 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 PIK3R3Q92569 461 aa3.59□□□□□ -1.83
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SGIP1-206ENST00000435165 SLC16A8O95907 504 aa3.59□□□□□ -1.83
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SGIP1-206ENST00000435165 BLOC1S1P78537 153 aa3.59□□□□□ -1.83
SGIP1-206ENST00000435165 IL18R1Q13478 541 aa3.59□□□□□ -1.83
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SGIP1-206ENST00000435165 A0A1B0GTH6 734 aa3.59□□□□□ -1.84
SGIP1-206ENST00000435165 GRID2IPA4D2P6 1211 aa3.59□□□□□ -1.84
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