RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC22A7Q9Y694 548 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKRD62A6NC57 917 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STX7O15400 261 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 REM1O75628 298 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AP2A2O94973 939 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNX4O95219 450 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DESP17661 470 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL11P20809 199 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PROK1P58294 105 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 XIAPP98170 497 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RELBQ01201 579 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPRCAPQ14761 206 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYTL3Q4VX76 610 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC25Q86WR0 208 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAB42Q8N4Z0 105 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNTD1Q8N815 330 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAGEC3Q8TD91 643 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACAT2Q9BWD1 397 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TAS2R16Q9NYV7 291 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HAT1O14929 419 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AVILO75366 819 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MMEP08473 750 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHRM3P20309 590 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STARP49675 285 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GFRA1P56159 465 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RIN1Q13671 783 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOMO1Q15155 1222 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSC22D1Q15714 1073 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BBS9Q3SYG4 887 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 Q6ZSR9 355 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC22A15Q8IZD6 547 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC15A4Q8N697 577 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCT2Q8NC54 265 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM13CQ8NE31 585 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HBEGFQ99075 208 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POTEKPQ9BYX7 375 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C1RLQ9NZP8 487 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 JTBO76095 146 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLITRK5O94991 958 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TFP02787 698 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC37A1P57057 533 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OGDHQ02218 1023 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRC63Q05C16 580 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDCD1Q15116 288 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHKG1Q16816 387 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NRN1LQ496H8 165 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GBP6Q6ZN66 633 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLD3Q8IV08 490 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAD51AP1Q96B01 352 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEP63Q96MT8 703 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MCEEQ96PE7 176 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MACROD1Q9BQ69 325 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MMACHCQ9Y4U1 282 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A0G2JMP0 313 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A0X1KG70 313 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FTH1P02794 183 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO45P0C2W1 286 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX5P17844 614 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARNTP27540 789 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP2R1BP30154 601 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MASP1P48740 699 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ASPHQ12797 758 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DPYSL2Q16555 572 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ISM2Q6H9L7 571 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNX20Q7Z614 316 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRT77Q7Z794 578 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PACS2Q86VP3 889 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM59Q8IWR1 403 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR4M2Q8NGB6 313 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC30A5Q8TAD4 765 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RILPQ96NA2 401 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms