RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417985.1

ACTBP1-201, Transcript of actin, beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP1, Length 1,113 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP1-201ENST00000417985 LACC1Q8IV20 430 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 SPATA6LQ8N4H0 392 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ZNF441Q8N8Z8 693 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 LINC01560Q8TB33 94 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 SLC22A8Q8TCC7 542 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 DOK4Q8TEW6 326 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 FBXL20Q96IG2 436 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 C18orf12Q96KH6 178 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 RUNDC3BQ96NL0 473 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 PRDM14Q9GZV8 571 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 CNIH4Q9P003 139 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 JRKLQ9Y4A0 524 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 IKBKGQ9Y6K9 419 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 MPDZO75970 2070 aa10.65□□□□□ -0.7
ACTBP1-201ENST00000417985 ANKRD33BA6NCL7 494 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 TUBAL3A6NHL2 446 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 WASHC1A8K0Z3 465 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 CLGNO14967 610 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 HPNP05981 417 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 INHBBP09529 407 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 SLC37A1P57057 533 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 TGM3Q08188 693 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 MGAT5Q09328 741 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 EBPQ15125 230 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 PPP1R7Q15435 360 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 SPRED3Q2MJR0 410 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 NHSL2Q5HYW2 709 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 CDKL4Q5MAI5 379 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 DCST1Q5T197 706 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 TMEM198Q66K66 360 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 VASNQ6EMK4 673 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 CHSY3Q70JA7 882 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 FRA10AC1Q70Z53 315 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 PRIMA1Q86XR5 153 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 LAS2Q8IYD9 372 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 TCAIMQ8N3R3 496 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 PDPRQ8NCN5 879 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 LRRC39Q96DD0 335 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 DGAT2Q96PD7 388 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 EFCAB11Q9BUY7 163 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 ROGDIQ9GZN7 287 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 WWTR1Q9GZV5 400 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 EPB41L4BQ9H329 900 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 RHOJQ9H4E5 214 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 POPDC3Q9HBV1 291 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 SMYD2Q9NRG4 433 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 ASIC3Q9UHC3 531 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa10.64□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 NINQ8N4C6 2090 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 CD8B2A6NJW9 211 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 SH3BGRLO75368 114 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 STK16O75716 305 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 PIAS1O75925 651 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 TGFB1P01137 390 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 HRGP04196 525 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 COX7A2P14406 83 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 CD1DP15813 335 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 CPN2P22792 545 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 GDF1P27539 372 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 SOX18P35713 384 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 MSH2P43246 934 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 CDK9P50750 372 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 HERVK_113P63132 956 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 ERVK-8P63133 956 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 SORDQ00796 357 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 PCDH1Q08174 1060 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 CHIT1Q13231 466 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 KEAP1Q14145 624 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 MORF4L2Q15014 288 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 PDK4Q16654 411 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 TMEM35AQ53FP2 167 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 C18orf63Q68DL7 685 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 BICRALQ6AI39 1079 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 SULT1C3Q6IMI6 304 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 LRRC8AQ8IWT6 810 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 PDIK1LQ8N165 341 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 LIX1Q8N485 282 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 SNX31Q8N9S9 440 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 FAM13CQ8NE31 585 aa10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ACTBP1-201ENST00000417985 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms