RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 CEBPEQ15744 281 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 CEP68Q76N32 757 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 PRSS41Q7RTY9 318 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 HIPK1Q86Z02 1210 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC38A5Q8WUX1 472 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF681Q96N22 645 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 PHF11Q9UIL8 331 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1B0GTW7 788 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 B3GALT2O43825 422 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 SDC3O75056 442 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 ALBP02768 609 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 ALOX12P18054 663 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 OLR1P78380 273 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 MAPK11Q15759 364 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 GPR19Q15760 415 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 REEP3Q6NUK4 255 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM64Q6YI46 380 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 SPPL2AQ8TCT8 520 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM19Q96HH6 336 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 CSF3RQ99062 836 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 OR51I1Q9H343 314 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 IL21RQ9HBE5 538 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 CD320Q9NPF0 282 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 STARD5Q9NSY2 213 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 DAPP1Q9UN19 280 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 USP34Q70CQ2 3546 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF860A6NHJ4 632 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 TFPTP0C1Z6 253 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 CDH3P22223 829 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 LAPTM4AQ15012 233 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 IFI44LQ53G44 452 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM107Q6UX40 140 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 OFCC1Q8IZS5 231 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 CSNK1A1LQ8N752 337 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 OR5D16Q8NGK9 328 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 SFXN5Q8TD22 340 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 RAB23Q9ULC3 237 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 OR12D1P0DN82 309 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 MPIP34949 423 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 CLCN2P51788 898 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 PRKAG1P54619 331 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 DEFB110Q30KQ9 67 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 CYP27C1Q4G0S4 372 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 USP51Q70EK9 711 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 SHISA5Q8N114 240 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 SMYD1Q8NB12 490 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 AVL9Q8NBF6 648 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 OR9A2Q8NGT5 310 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 MBOAT4Q96T53 435 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 TOR3AQ9H497 397 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 UCKL1Q9NWZ5 548 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 NINQ8N4C6 2090 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 PRAMEF25A6NGN4 478 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 C5orf58C9J3I9 102 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 H0YAE9 185 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 HS6ST1O60243 411 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 CTSBP07858 339 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 LINGO3P0C6S8 592 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 MATN1P21941 496 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 OR1E2P47887 323 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 LZICQ8WZA0 190 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 RDH12Q96NR8 316 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 UCK1Q9HA47 277 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 PSME2Q9UL46 239 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 LILRA5A6NI73 299 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 LMO7DNF2Z398 122 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 IFNA14P01570 189 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 PROS1P07225 676 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 FPR1P21462 350 aa20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SH3BP5-204ENST00000412806 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms