RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NEK2P51955 445 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLDN8P56748 225 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SOX8P57073 446 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FOLH1Q04609 750 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CEACAM7Q14002 265 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NCF4Q15080 339 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPE65Q16518 533 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C3AR1Q16581 482 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VPS26BQ4G0F5 336 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SGO1Q5FBB7 561 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C1orf146Q5VVC0 180 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MED27Q6P2C8 311 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AAGABQ6PD74 315 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAB42Q8N4Z0 105 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ABHD11Q8NFV4 315 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR4K1Q8NGD4 311 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR2L8Q8NGY9 312 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMPDL3AQ92484 453 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 JADE3Q92613 823 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NINJ1Q92982 152 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UBE2E3Q969T4 207 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C18orf12Q96KH6 178 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C12orf66Q96MD2 445 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDRT15Q96T59 188 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NT5DC2Q9H857 520 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UCK1Q9HA47 277 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPAG4Q9NPE6 437 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GID8Q9NWU2 228 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 P4HTMQ9NXG6 502 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VPS29Q9UBQ0 182 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD300AQ9UGN4 299 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TINAGQ9UJW2 476 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POMPQ9Y244 141 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CACNA1CQ13936 2221 aa8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC154A6NI56 674 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR5K4A6NMS3 321 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CFLARO15519 480 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KDM1AO60341 852 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ALOX12BO75342 701 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FKBP6O75344 327 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WISP2O76076 250 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSMG1O95456 288 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VIPP01282 170 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IL6P05231 212 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HEXAP06865 529 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MST1P26927 711 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL10P27635 214 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PKLRP30613 574 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SERPINB1P30740 379 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RORAP35398 523 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GCKP35557 465 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC19A1P41440 591 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CAPZBP47756 277 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAB28P51157 221 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NME5P56597 212 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NOXRED1Q6NXP6 359 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SUSD1Q6UWL2 747 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMPRSS11BQ86T26 416 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RIMKLAQ8IXN7 391 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LIX1Q8N485 282 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC01555Q8NAE3 123 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HUS1BQ8NHY5 278 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TESCQ96BS2 214 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 APIPQ96GX9 242 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IP6K3Q96PC2 410 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IL17FQ96PD4 163 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZBTB18Q99592 522 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MAP3K3Q99759 626 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RHBGQ9H310 441 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NMRK1Q9NWW6 199 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SEC14L3Q9UDX4 400 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CIDEBQ9UHD4 219 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms