RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410293.1

RNU6-447P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 447, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-447P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-447P-201ENST00000410293 FNTAP49354 379 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 NPY4RP50391 375 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 PEX3P56589 373 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 STX17P56962 302 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 KRTAP12-4P60329 112 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ARHGAP1Q07960 439 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ASAH1Q13510 395 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CAMK2DQ13557 499 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CRMP1Q14194 572 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 KCTD2Q14681 263 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 EMC2Q15006 297 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SPHARQ15513 63 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 OR1C1Q15619 314 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 PRR4Q16378 134 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 IL17AQ16552 155 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 MICAQ29983 383 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CCDC14Q49A88 953 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 IQCCQ4KMZ1 466 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 C14orf28Q4W4Y0 310 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SBK1Q52WX2 424 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 KRBOX4Q5JUW0 171 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 TAF3Q5VWG9 929 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 FAM219BQ5XKK7 198 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SLC22A10Q63ZE4 541 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 C2orf66Q6UXQ4 117 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ZNF677Q86XU0 584 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CROCCP3Q8IVE0 287 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ARL14Q8N4G2 192 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CARNMT1Q8N4J0 409 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 TPRX1Q8N7U7 411 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 IQUBQ8NA54 791 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 RNF149Q8NC42 400 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 KIF18AQ8NI77 898 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 GOLGA5Q8TBA6 731 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CKAP2Q8WWK9 683 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 TCP11Q8WWU5 503 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CRYGNQ8WXF5 182 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 DNASE1L2Q92874 299 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 VPS33AQ96AX1 596 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ELSPBP1Q96BH3 223 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ERO1AQ96HE7 468 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 PCED1BQ96HM7 432 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CASD1Q96PB1 797 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SERINC2Q96SA4 455 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SSX3Q99909 188 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 C17orf62Q9BQA9 187 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ZNF559Q9BR84 538 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 RABEP2Q9H5N1 569 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 Q9HAA7 133 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 IL1RL2Q9HB29 575 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 S100A14Q9HCY8 104 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 RAB9BQ9NP90 201 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 MIEF1Q9NQG6 463 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 DNAJC11Q9NVH1 559 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 TMOD3Q9NYL9 352 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CIDEBQ9UHD4 219 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 RSPH14Q9UHP6 348 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 GPR132Q9UNW8 380 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 TTLL3Q9Y4R7 772 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ETV7Q9Y603 341 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 SH3PXD2BA1X283 911 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 MAGEB16A2A368 324 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 KBTBD13C9JR72 458 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 SLC17A2O00624 439 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 GPAA1O43292 621 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 LRRTM2O43300 516 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 LATO43561 262 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 KIAA0513O60268 411 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 RTN2O75298 545 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 NME6O75414 186 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 STAM2O75886 525 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 SERF1AO75920 110 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 TXNDC12O95881 172 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 GOT2P00505 430 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 CALCAP01258 141 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 IGHV3-23P01764 117 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 RPN1P04843 607 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-447P-201ENST00000410293 ASNSP08243 561 aa0.46□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms