RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 FOXA1P55317 472 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 RNF4P78317 190 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 HMGCS1Q01581 520 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC153Q494R4 210 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 OR52E8Q6IFG1 317 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 EMBQ6PCB8 327 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 PAGE2Q7Z2X7 111 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ARMC10Q8N2F6 343 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 TMEM178AQ8NBL3 297 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 AGAP11Q8TF27 550 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC126Q96EE4 140 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 PARD6BQ9BYG5 372 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 BRF2Q9HAW0 419 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 MYOTQ9UBF9 498 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 VPS29Q9UBQ0 182 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 COPS7AQ9UBW8 275 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ADAM29Q9UKF5 820 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 NME2P1O60361 137 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ULK1O75385 1050 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 UNC5CO95185 931 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ESRRBO95718 433 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 NME2P22392 152 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 PKNOX1P55347 436 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ERVK-8P63133 956 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF750Q32MQ0 723 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 CFAP157Q5JU67 520 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 MDGA2Q7Z553 956 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 CAVIN3Q969G5 261 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 TMEM125Q96AQ2 219 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ZBTB9Q96C00 473 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ACPTQ9BZG2 426 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ERVK-11Q9UQG0 969 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ERVK-19Q9WJR5 959 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ESPL1Q14674 2120 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 DYRK3O43781 588 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 SPAG7O75391 227 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 OR6B1O95007 311 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ENO1P06733 434 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 PIK3R1P27986 724 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 RFC3P40938 356 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC18A2Q05940 514 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 BTKQ06187 659 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 IL20RBQ6UXL0 311 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 GFRALQ6UXV0 394 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 DNAJB8Q8NHS0 232 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ASB15Q8WXK1 588 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 RIT1Q92963 219 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 FRMD6Q96NE9 622 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 RASL10BQ96S79 203 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 OXSMQ9NWU1 459 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 NMRK1Q9NWW6 199 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 SEC14L3Q9UDX4 400 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 A8MVJ9 347 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 NPIPA5E9PKD4 350 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 CRCPO75575 148 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 IGKV3-11P04433 115 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 PTGER1P34995 402 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 SOX3P41225 446 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ALDH9A1P49189 494 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 GPR85P60893 370 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 FRMD7Q6ZUT3 714 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 TRABD2AQ86V40 505 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 C10orf107Q8IVU9 208 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 C9orf40Q8IXQ3 194 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 OR4K14Q8NGD5 310 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 RDH11Q8TC12 318 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 SSC4DQ8WTU2 575 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 APIPQ96GX9 242 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 FBXL20Q96IG2 436 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 APOPT1Q96IL0 206 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 HPF1Q9NWY4 346 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 NPIPA1Q9UND3 350 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 PTPN13Q12923 2485 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 G3V3Y1 287 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC35E2P0CK97 266 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 HSD3B1P14060 373 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 HSD3B2P26439 372 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 SERPINB3P29508 390 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 MEOX1P50221 254 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRN2-204ENST00000404321 XKP51811 444 aa16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms