RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TMEM200CA6NKL6 621 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TRIM49D1C9J1S8 452 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 AQP7O14520 342 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SUSD5O60279 629 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 CTNSO60931 367 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 WDR1O75083 606 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 CLEC3AO75596 197 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 P04436 131 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 GLI4P10075 376 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TNNI3P19429 210 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 CNR1P21554 472 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 CERS1P27544 350 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 MAGEA5P43359 124 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 MAN2A2P49641 1150 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 HK2P52789 917 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 MTTPP55157 894 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 LIM2P55344 173 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 PPP2R2AP63151 447 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 DOC2AQ14183 400 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TEX35Q5T0J7 233 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 WLSQ5T9L3 541 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 OPN5Q6U736 354 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TRILQ7L0X0 811 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 LCA5Q86VQ0 697 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 LAS2Q8IYD9 372 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TMEM251Q8N6I4 163 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 OR5L2Q8NGL0 311 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 OR8K3Q8NH51 312 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 NRGNQ92686 78 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SARAFQ96BY9 339 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 MTBPQ96DY7 904 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SCYL1Q96KG9 808 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 QRFPRQ96P65 431 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 FOXC2Q99958 501 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 LDAHQ9H6V9 325 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 EXO5Q9H790 373 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SACM1LQ9NTJ5 587 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ZNF358Q9NW07 568 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 EDARQ9UNE0 448 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 CLDN16Q9Y5I7 305 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 FAM215AQ9Y5M1 114 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 LIPGQ9Y5X9 500 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 IKBKGQ9Y6K9 419 aa11.42□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 A0A0G2JNJ9 132 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GVC2 190 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 FAM221AA4D161 298 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 C17orf105B2RV13 164 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SUPT3HB4E1H0 165 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 CYR61O00622 381 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 STX16O14662 325 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 CLGNO14967 610 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SUPT3HO75486 399 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ATP6AP2O75787 350 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 S100BP04271 92 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 RBP1P09455 135 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 COX7A2P14406 83 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 PEX19P40855 299 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 IST1P53990 364 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 RNF4P78317 190 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 LAPTM5Q13571 262 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SERTAD2Q14140 314 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ZNF750Q32MQ0 723 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 C1orf185Q5T7R7 199 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 KLC3Q6P597 504 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ARSKQ6UWY0 536 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SH2D5Q6ZV89 423 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TDRPQ86YL5 185 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SLC2A12Q8TD20 617 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 KCNC2Q96PR1 638 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 CSF3RQ99062 836 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 ROGDIQ9GZN7 287 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 VPS11Q9H270 941 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 LYRM4Q9HD34 91 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 OPTCQ9UBM4 332 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 VTI1BQ9UEU0 232 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 Q9UFV3 132 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 TMCO1Q9UM00 188 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 DAPP1Q9UN19 280 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 SPACA6W5XKT8 324 aa11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PRAME-204ENST00000403441 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.4□□□□□ -0.584e-11■□□□□ 9.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms