RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM38AQ9H6F2 299 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 NTN4Q9HB63 628 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TM9SF3Q9HD45 589 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TAS2R9Q9NYW1 312 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SH3BP4Q9P0V3 963 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CES1P1Q9UKY3 287 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 RAB26Q9ULW5 256 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 U3KQE9 123 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 A0A0J9YY10 115 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1W2PR48 441 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1W2PRB8 838 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP10A1A4S6 786 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 C7orf72A4D263 438 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 OR6C74A6NCV1 312 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 LILRA5A6NI73 299 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 MYO1GB0I1T2 1018 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 LMO7DNF2Z398 122 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 DLGAP1O14490 977 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PPM1DO15297 605 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CLOCKO15516 846 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PDPK1O15530 556 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ZW10O43264 779 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PROM1O43490 865 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 NOBOXO60393 691 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 GUCY1B2O75343 617 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 GMNNO75496 209 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 KRT75O95678 551 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 LDLRP01130 860 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 FAM58BPP0C7Q3 252 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 MED14OSP0DP75 135 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CTSEP14091 401 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 MAGP20916 626 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 BCKDHBP21953 392 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 UQCRC2P22695 453 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 KDELR2P33947 212 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SSR2P43308 183 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CRYBA2P53672 197 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PLA2G16P53816 162 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CHRNB3Q05901 458 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 RGS1Q08116 209 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TGM3Q08188 693 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SLC9A5Q14940 896 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 C16orf72Q14CZ0 275 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ELOCQ15369 112 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC36Q1X8D7 754 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF542PQ5EBM4 170 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM40Q6P9F5 258 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ADCK2Q7Z695 626 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ASPGQ86U10 573 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 GKN2Q86XP6 184 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SFTPA2Q8IWL1 248 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 MARVELD2Q8N4S9 558 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TRIML2Q8N7C3 387 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 FAM86B1Q8N7N1 296 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ICA1LQ8NDH6 482 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CDC26Q8NHZ8 85 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 KLHL6Q8WZ60 621 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 FIG4Q92562 907 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 EME1Q96AY2 570 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 NEURL3Q96EH8 262 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PYURFQ96I23 114 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 C10orf90Q96M02 699 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 RNF145Q96MT1 663 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF681Q96N22 645 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF285Q96NJ3 590 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SLC29A1Q99808 456 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 C17orf62Q9BQA9 187 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SLC35A5Q9BS91 424 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 C9orf16Q9BUW7 83 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 FAIM2Q9BWQ8 316 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ROGDIQ9GZN7 287 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 RAB33BQ9H082 229 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 RAD21L1Q9H4I0 556 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PIF1Q9H611 641 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 YY1AP1Q9H869 796 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 COQ10BQ9H8M1 238 aa5.69□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.2 ms