RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 CHN2P52757 468 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RABGGTBP53611 331 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TUBA1BP68363 451 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MYL5Q02045 173 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MELKQ14680 651 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PAGE2BQ5JRK9 111 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 WSCD1Q658N2 575 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 DOK6Q6PKX4 331 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CD300LDQ6UXZ3 194 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TUBA1AQ71U36 451 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC80Q76M96 950 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 POLNQ7Z5Q5 900 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 GPR141Q7Z602 305 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC6Q86X45 466 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MFN1Q8IWA4 741 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TERB1Q8NA31 727 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TRPV3Q8NET8 790 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MDGA1Q8NFP4 955 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SLC9A6Q92581 669 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 FAM136AQ96C01 138 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MAGED4Q96JG8 741 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MS4A10Q96PG2 267 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CITED1Q99966 193 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM51Q9BSJ1 452 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MSTO1Q9BUK6 570 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 C10orf88Q9H8K7 445 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TUBG2Q9NRH3 451 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 NRBP2Q9NSY0 501 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 STARD5Q9NSY2 213 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SMOXQ9NWM0 555 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CD274Q9NZQ7 290 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MYO3BQ8WXR4 1341 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 BTN3A3O00478 584 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 GYG2O15488 501 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ACSL4O60488 711 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PCCBP05166 539 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ENO1P06733 434 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RNF224P0DH78 156 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SPP1P10451 314 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CYP2C8P10632 490 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CA4P22748 312 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 GNA11P29992 359 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PRKAR1BP31321 381 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 BMI1P35226 326 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PTGER4P35408 488 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RPL21P46778 160 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 HSPA2P54652 639 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 BPIFB4P59827 614 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 FCHO2Q0JRZ9 810 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 NAE1Q13564 534 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 DMC1Q14565 340 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PMVKQ15126 192 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC66Q68CR7 880 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 FAM166AQ6J272 317 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TPRG1Q6ZUI0 275 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TRILQ7L0X0 811 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CUZD1Q86UP6 607 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SLC51BQ86UW2 128 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SFR1Q86XK3 245 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 STX19Q8N4C7 294 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB2Q8N680 514 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 OR14L1PQ8NHC6 308 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TPD52L3Q96J77 140 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 BTF3L4Q96K17 158 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 QRFPRQ96P65 431 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CHP1Q99653 195 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CCT7Q99832 543 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CENPKQ9BS16 269 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TIMM29Q9BSF4 260 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SUCNR1Q9BXA5 334 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 DCTPP1Q9H773 170 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 HEY2Q9UBP5 337 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 HACL1Q9UJ83 578 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 STOML2Q9UJZ1 356 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA1257Q9ULG3 409 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM129A0AVI4 362 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PDZK1P1A8MUH7 402 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD65E5RJM6 399 aa2.35□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PDXKO00764 312 aa2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms