RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 BBS4Q96RK4 519 aa26.06■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 ARMCX1Q9P291 453 aa26.06■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 C9JVG2 144 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 C8orf89P0DMQ9 161 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 F8A1P23610 371 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 RCAN2Q14206 197 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 CEBPEQ15744 281 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 FUNDC1Q8IVP5 155 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 GATA6Q92908 595 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 TSLPQ969D9 159 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 WDR70Q9NW82 654 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 CLDN16Q9Y5I7 305 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 DYTNA2CJ06 578 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 PGRP06401 933 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 UMODP07911 640 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 CPMP14384 443 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 PORP16435 677 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 MPIP34949 423 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 FEN1P39748 380 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 EFNA3P52797 238 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 RPS18P62269 152 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 PLIN5Q00G26 463 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 CLN3Q13286 438 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 MAPRE2Q15555 327 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 PRSS53Q2L4Q9 553 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 FAM180BQ6P0A1 224 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 VPS37AQ8NEZ2 397 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 KCNE4Q8WWG9 221 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF681Q96N22 645 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC106Q9BWC9 280 aa26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 TGFBR3LH3BV60 316 aa26.04■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 SLC35E2P0CK97 266 aa26.04■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 SSPNQ14714 243 aa26.04■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 ANXA8L1Q5VT79 327 aa26.04■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 OR4F3Q6IEY1 312 aa26.04■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 AKAP13Q12802 2813 aa26.04■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 MYO1GB0I1T2 1018 aa26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 NR5A2O00482 541 aa26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 FAM69BQ5VUD6 431 aa26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 FAAH2Q6GMR7 532 aa26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 ZFP28Q8NHY6 868 aa26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 TSPEARQ8WU66 669 aa26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 NACC2Q96BF6 587 aa26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 SPDL1Q96EA4 605 aa26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 DGAT2Q96PD7 388 aa26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC154A6NI56 674 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 CFLARO15519 480 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 OR10H2O60403 315 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 LIFP15018 202 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 MMP11P24347 488 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 FRKP42685 505 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 STT3AP46977 705 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 DGKQP52824 942 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 MPEG1Q2M385 716 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM205Q6UW68 189 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 GK5Q6ZS86 529 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM151BQ8IW70 566 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 ERP27Q96DN0 273 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 OR52E6Q96RD3 313 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 DPH1Q9BZG8 443 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 IL17BQ9UHF5 180 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 IFNA16P05015 189 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC74AQ0VAA2 488 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF750Q32MQ0 723 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 TIGD2Q4W5G0 525 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 ADAP2Q9NPF8 381 aa26.02■■□□□ 1.76
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PS29 197 aa26.01■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 ATP1B1P05026 303 aa26.01■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 MANFP55145 182 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 CPZQ66K79 652 aa26.01■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 LANCL3Q6ZV70 420 aa26.01■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 ANKRD37Q7Z713 158 aa26.01■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 VASH2Q86V25 355 aa26.01■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC116Q8IYX3 515 aa26.01■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 SLC25A23Q9BV35 468 aa26.01■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 RMND5AQ9H871 391 aa26.01■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa26■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa26■■□□□ 1.75
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PRB8 838 aa26■■□□□ 1.75
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