RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV3-11P04433 115 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 SP1P08047 785 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHN1P15882 459 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 NME2P22392 152 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 MST1P26927 711 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJB13P59910 316 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 BIKQ13323 160 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A25Q6KCM7 469 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSDL2Q6YN16 418 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRMD7Q6ZUT3 714 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 APOPT1Q96IL0 206 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACPTQ9BZG2 426 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 OXSMQ9NWU1 459 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYOTQ9UBF9 498 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP10A1A4S6 786 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASPDHA6ND91 283 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 PGRMC2O15173 223 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGFG2O95081 481 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRYABP02511 175 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPA3P15088 417 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 HK2P52789 917 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPK12P53778 367 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAGLUP54802 743 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXA1P55317 472 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF4P78317 190 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFFO1Q0D2I5 559 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCLAFQ15004 111 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPRED3Q2MJR0 410 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 MREGQ8N565 214 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 BANPQ8N9N5 519 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC63Q8NA47 563 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR8K3Q8NH51 312 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJB8Q8NHS0 232 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXL20Q96IG2 436 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRMD6Q96NE9 622 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARD6BQ9BYG5 372 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 MID1IP1Q9NPA3 183 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 NMRK1Q9NWW6 199 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS29Q9UBQ0 182 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 COPS7AQ9UBW8 275 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIMM22Q9Y584 194 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 ULK1O75385 1050 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2J2O76002 312 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF224P0DH78 156 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSR4P51571 173 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAA20P61599 178 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf40Q8IXQ3 194 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP21Q8N119 569 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM156Q8N614 296 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 DOK4Q8TEW6 326 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASL10BQ96S79 203 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLLPQ9Y342 182 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa18.15■□□□□ 0.5
PTPRCAP-201ENST00000326294 WWP2O00308 870 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10H2O60403 315 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC35E2P0CK97 266 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 GALNSP34059 522 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK-8P63133 956 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMGCS1Q01581 520 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAPKAPK3Q16644 382 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 LIPMQ5VYY2 423 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 C10orf107Q8IVU9 208 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHTF18Q8WVB6 975 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 TM4SF18Q96CE8 201 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ART5Q96L15 291 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNPPD1Q9BV87 410 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 MID2Q9UJV3 735 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB21Q9UL25 225 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK-19Q9WJR5 959 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1orf226A1L170 272 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC151A5D8V7 595 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 DYRK3O43781 588 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 WISP2O76076 250 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR6B1O95007 311 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLPSP04118 112 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIK3R1P27986 724 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOX3P41225 446 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNK10P57789 538 aa18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAE1P78406 368 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP157Q5JU67 520 aa18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms