RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PGAM4Q8N0Y7 254 aa25.78■■□□□ 1.72
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMDHD1Q96NU7 426 aa25.78■■□□□ 1.72
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLAMF8Q9P0V8 285 aa25.78■■□□□ 1.72
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa25.77■■□□□ 1.72
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS58Q8IYP2 241 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 STT3BQ8TCJ2 826 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTCHD1Q96NR3 888 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC39A3Q9BRY0 314 aa25.76■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa25.76■■□□□ 1.71
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C9orf172C9J069 976 aa25.75■■□□□ 1.71
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CTDNEP1-201ENST00000318988 QSOX2Q6ZRP7 698 aa25.75■■□□□ 1.71
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SCUBE1Q8IWY4 988 aa25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP24Q8N264 748 aa25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHST8Q9H2A9 424 aa25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 PADI1Q9ULC6 663 aa25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa25.74■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa25.73■■□□□ 1.71
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PS29 197 aa25.73■■□□□ 1.71
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