RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 SAGE2PA6NJ88 616 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 A6NL46 340 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 AKAP10O43572 662 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 OR10H2O60403 315 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 PRPS2P11908 318 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 ITGA3P26006 1051 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 ASMTP46597 345 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 XKP51811 444 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 PLIN5Q00G26 463 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 BIKQ13323 160 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 BTBD16Q32M84 506 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 IMMP1LQ96LU5 166 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa20.89■□□□□ 0.94
HOXD4-201ENST00000306324 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa20.89■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 CELA2AP08217 269 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 VIMP08670 466 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 G6PDP11413 515 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 COX7A2P14406 83 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 FEN1P39748 380 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 STT3AP46977 705 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 RHDQ02161 417 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 Q0VFX4 171 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 PTGR1Q14914 329 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF750Q32MQ0 723 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 TICAM1Q8IUC6 712 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC34Q8IZ02 419 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 EHD3Q9NZN3 535 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 C17orf105B2RV13 164 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 TGDSO95455 350 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 ICAM2P13598 275 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 CPMP14384 443 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 AQP5P55064 265 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 DIO3P55073 304 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 SLC26A5P58743 744 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 RAPSNQ13702 412 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 EXT1Q16394 746 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 PLAG1Q6DJT9 500 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 EPGNQ6UW88 154 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 KBTBD2Q8IY47 623 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 GALNT16Q8N428 558 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC134Q9H6E4 229 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 ASIC5Q9NY37 505 aa20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 SLC35E2P0CK97 266 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 PORP16435 677 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 PGDP52209 483 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 POLE2P56282 527 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 TERF2Q15554 542 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 OGFOD2Q6N063 350 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 OR14A16Q8NHC5 309 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 DOK4Q8TEW6 326 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 OR52B2Q96RD2 323 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 REEP4Q9H6H4 257 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 NPHS2Q9NP85 383 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 ENTPD4Q9Y227 616 aa20.87■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 DYRK3O43781 588 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 SERPINA7P05543 415 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 HPCAL1P37235 193 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 LINC00303Q3SY05 128 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 ACAD11Q709F0 780 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 B3GNT7Q8NFL0 401 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 CEP70Q8NHQ1 597 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 ACTRT2Q8TDY3 377 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 TTC9Q92623 222 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 OR8D2Q9GZM6 311 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 LHX6Q9UPM6 363 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa20.86■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 NT5EP21589 574 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 IDH3AP50213 366 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 GYS2P54840 703 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 PRSS53Q2L4Q9 553 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 SPATA19Q7Z5L4 167 aa20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HOXD4-201ENST00000306324 M1APQ8TC57 530 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms