RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293826.4

TNFSF12-TNFSF13-201, Transcript of TNFSF12-TNFSF13 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFSF12-TNFSF13, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NDUFA9Q16795 377 aa22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF750Q32MQ0 723 aa22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GLYATQ6IB77 296 aa22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPR135Q8IZ08 494 aa22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR2T12Q8NG77 320 aa22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CCDC115Q96NT0 180 aa22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C1QCP02747 245 aa22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GPIP06744 558 aa22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PEX2P28328 305 aa22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 C1orf189Q5VU69 101 aa22.5■■□□□ 1.19
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PMEPA1Q969W9 287 aa22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MTERF3Q96E29 417 aa22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FANCEQ9HB96 536 aa22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLAMF7Q9NQ25 335 aa22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ATAD3AQ9NVI7 634 aa22.5■■□□□ 1.19
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TCRBV5S2A0A599 114 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PMS2P1A4D2B8 440 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CHST10O43529 356 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GMNNO75496 209 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 UMPSP11172 480 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GGT1P19440 569 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CPN2P22792 545 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM53BQ14153 422 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRRC36Q1X8D7 754 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IZUMO2Q6UXV1 221 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CALHM3Q86XJ0 350 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 BMPERQ8N8U9 685 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FER1L5A0AVI2 2057 aa22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 VGLL3A8MV65 326 aa22.48■■□□□ 1.19
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CAPNS1P04632 268 aa22.48■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 IL10P22301 178 aa22.48■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SOX11P35716 441 aa22.48■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TNFRSF17Q02223 184 aa22.48■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ZNF621Q6ZSS3 439 aa22.48■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ADGRG5Q8IZF4 528 aa22.48■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 SLC38A9Q8NBW4 561 aa22.48■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NSMCE2Q96MF7 247 aa22.48■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ENAMQ9NRM1 1142 aa22.48■■□□□ 1.19
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAM220BPB1ANY3 271 aa22.47■■□□□ 1.19
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NR2F6P10588 404 aa22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GZMMP51124 257 aa22.47■■□□□ 1.19
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MAP7Q14244 749 aa22.47■■□□□ 1.19
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 PEX11GQ96HA9 241 aa22.47■■□□□ 1.19
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TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 NDC1Q9BTX1 674 aa22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 FAIM2Q9BWQ8 316 aa22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CES1P1Q9UKY3 287 aa22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 RARRES3Q9UL19 164 aa22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR2W5A6NFC9 320 aa22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 CYR61O00622 381 aa22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 GSTA4O15217 222 aa22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ITIH1P19827 911 aa22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ABHD18Q0P651 414 aa22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 ILKQ13418 452 aa22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 OR4N5Q8IXE1 308 aa22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 MICU2Q8IYU8 434 aa22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 LRTOMTQ8WZ04 291 aa22.47■■□□□ 1.19
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