RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291386.3

SSU72-201, Transcript of SSU72 homolog, RNA polymerase II CTD phosphatase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SSU72, Length 1,290 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72-201ENST00000291386 RAPSNQ13702 412 aa25.12■■□□□ 1.61
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SSU72-201ENST00000291386 IGFL3Q6UXB1 125 aa25.12■■□□□ 1.61
SSU72-201ENST00000291386 APCDD1LQ8NCL9 501 aa25.12■■□□□ 1.61
SSU72-201ENST00000291386 MORN4Q8NDC4 146 aa25.12■■□□□ 1.61
SSU72-201ENST00000291386 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SSU72-201ENST00000291386 C19orf60Q96EN9 201 aa25.12■■□□□ 1.61
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SSU72-201ENST00000291386 C3orf30Q96M34 536 aa25.12■■□□□ 1.61
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SSU72-201ENST00000291386 ISLR2Q6UXK2 745 aa25.1■■□□□ 1.61
SSU72-201ENST00000291386 MMP21Q8N119 569 aa25.1■■□□□ 1.61
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SSU72-201ENST00000291386 SMU1Q2TAY7 513 aa25.09■■□□□ 1.61
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SSU72-201ENST00000291386 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
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SSU72-201ENST00000291386 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa25.07■■□□□ 1.6
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SSU72-201ENST00000291386 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa25.07■■□□□ 1.6
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SSU72-201ENST00000291386 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SSU72-201ENST00000291386 KIF2BQ8N4N8 673 aa25.06■■□□□ 1.6
SSU72-201ENST00000291386 SLC5A8Q8N695 610 aa25.06■■□□□ 1.6
SSU72-201ENST00000291386 OR8K3Q8NH51 312 aa25.06■■□□□ 1.6
SSU72-201ENST00000291386 LRRC8CQ8TDW0 803 aa25.06■■□□□ 1.6
SSU72-201ENST00000291386 RIT1Q92963 219 aa25.06■■□□□ 1.6
SSU72-201ENST00000291386 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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