RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291281.8

PRKD2-201, Transcript of protein kinase D2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKD2, Length 3,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2-201ENST00000291281 FANK1Q8TC84 345 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 CCDC120Q96HB5 630 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 ABCB9Q9NP78 766 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 KCND3Q9UK17 655 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 NDUFA2O43678 99 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 SCO1O75880 301 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 CKMT1AP12532 417 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 TRIM23P36406 574 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 CSKP41240 450 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 DAB2P98082 770 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 CDK6Q00534 326 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 DOC2AQ14183 400 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 QPRTQ15274 297 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 HSDL2Q6YN16 418 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 CADM2Q8N3J6 435 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 REPS1Q96D71 796 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 ALG14Q96F25 216 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 ZNF558Q96NG5 402 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 CD93Q9NPY3 652 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRKD2-201ENST00000291281 A0A0B4J293 547 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 FABP12A6NFH5 140 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 PI15O43692 258 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 BNIP3LO60238 219 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 PRAMEF10O60809 474 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 CPN2P22792 545 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 OR3A3P47888 321 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 FAPQ12884 760 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 RETSATQ6NUM9 610 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 TAGAPQ8N103 731 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 RNF31Q96EP0 1072 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 NIPAL2Q9H841 368 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 E7EQ34 232 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 OSMP13725 252 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 HBA1P69905 142 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 DDI2Q5TDH0 399 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 PHC2Q8IXK0 858 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 WDR70Q9NW82 654 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 SCN5AQ14524 2016 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 KPNA5O15131 536 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 ETHE1O95571 254 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 IFNW1P05000 195 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 URODP06132 367 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 HBQ1P09105 142 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 POU1F1P28069 291 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 VEPH1Q14D04 833 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 SAXO2Q658L1 398 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 SLC30A8Q8IWU4 369 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 ENKURQ8TC29 256 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 SGK2Q9HBY8 427 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 DIABLOQ9NR28 239 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 YIPF1Q9Y548 306 aa14.64□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 ARHGEF9O43307 516 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 PDE9AO76083 593 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 CDRT1O95170 752 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 IL12RB1P42701 662 aa14.63□□□□□ -0.07
PRKD2-201ENST00000291281 BPIFB3P59826 476 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms