RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 VWA5B2Q8N398 1253 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 OR56A3Q8NH54 315 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 OR14A16Q8NHC5 309 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 SLC5A11Q8WWX8 675 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 ATL1Q8WXF7 558 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 WNT2BQ93097 391 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 ISL2Q96A47 359 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 PYCR2Q96C36 320 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 CCT8L2Q96SF2 557 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 PHACTR1Q9C0D0 580 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 OR8D2Q9GZM6 311 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 KLHL31Q9H511 634 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 ARL15Q9NXU5 204 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 TRPS1Q9UHF7 1281 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 MXRA5Q9NR99 2828 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 C8BP07358 591 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 RFPL3SP0C7P2 107 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 SAT1P21673 171 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 TRPC1P48995 793 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 AP1S2P56377 157 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 IFFO1Q0D2I5 559 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 STX4Q12846 297 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 RUNX2Q13950 521 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 RCN2Q14257 317 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 MPEG1Q2M385 716 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 PIGGQ5H8A4 983 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 C6orf89Q6UWU4 347 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 GSTA5Q7RTV2 222 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 DENND6AQ8IWF6 608 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 CNPY4Q8N129 248 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 ANKRD53Q8N9V6 530 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 CALML6Q8TD86 181 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 NEIL2Q969S2 332 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 GAL3ST3Q96A11 431 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 KIAA1191Q96A73 305 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 OR4K3Q96R72 315 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 SLC6A15Q9H2J7 730 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 PELI2Q9HAT8 420 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 VTI1BQ9UEU0 232 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 DYRK1BQ9Y463 629 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 CLDN16Q9Y5I7 305 aa11.03□□□□□ -0.64
SPC25-201ENST00000282074 SH3D21A4FU49 640 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 RNF212BA8MTL3 300 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TGFBR3LH3BV60 316 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 B3GALT2O43825 422 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CTNSO60931 367 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 IL18BPO95998 194 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TPSB2P20231 275 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 FPR1P21462 350 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 WNT3P56703 355 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 REEP5Q00765 189 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CALCOCO2Q13137 446 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CBLBQ13191 982 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TPSAB1Q15661 275 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 KRT71Q3SY84 523 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ZDHHC24Q6UX98 284 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CLNKQ7Z7G1 428 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 C10orf67Q8IYJ2 551 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 FAM47BQ8NA70 645 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 C7orf57Q8NEG2 295 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SLC22A8Q8TCC7 542 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 PAQR8Q8TEZ7 354 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SERPINB12Q96P63 405 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TIMP4Q99727 224 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SPNS1Q9H2V7 528 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 TAS2R13Q9NYV9 303 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CNIH4Q9P003 139 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 JKAMPQ9P055 326 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 COPS7AQ9UBW8 275 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 NDRG3Q9UGV2 375 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ACTL7BQ9Y614 415 aa11.02□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ZANQ9Y493 2812 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 A0A1W2PPR1 153 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CD8B2A6NJW9 211 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 C17orf105B2RV13 164 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 ERN1O75460 977 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 CRLF1O75462 422 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 HAUS5O94927 633 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 F7P08709 466 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 HPDP32754 393 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 SLC1A2P43004 574 aa11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SPC25-201ENST00000282074 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms