RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 LINC00471Q8N535 108 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 OR9I1Q8NGQ6 314 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 LRCH3Q96II8 777 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 RANBP9Q96S59 729 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 MCHR1Q99705 422 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 SLC39A3Q9BRY0 314 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 MTMR10Q9NXD2 777 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 PGAP2Q9UHJ9 254 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 MYOGP15173 224 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 ARSDP51689 593 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 GRK1Q15835 563 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 NXPE4Q6UWF7 544 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 MFSD6LQ8IWD5 586 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 KLHL36Q8N4N3 616 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 ANKFN1Q8N957 763 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 ACVR1CQ8NER5 493 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 TRIB3Q96RU7 358 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 HHATLQ9HCP6 504 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 C14orf105Q9NVL8 296 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 ASB6Q9NWX5 421 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 NFS1Q9Y697 457 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 RNF13O43567 381 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 CSF2P04141 144 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 HOXC13P31276 330 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP13.21□□□□□ -0.291e-7■■■□□ 17
USP22-201ENST00000261497 ZNF81P51508 661 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 RHDQ02161 417 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 TMEM35AQ53FP2 167 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 TANGO2Q6ICL3 276 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 STOML3Q8TAV4 291 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 THAP6Q8TBB0 222 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 OR5P2Q8WZ92 322 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 GRHPRQ9UBQ7 328 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 GIMAP2Q9UG22 337 aa13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
USP22-201ENST00000261497 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 CSN2P05814 226 aa13.21□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 S100A12P80511 92 aa13.21□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 ADAM15Q13444 863 aa13.21□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 LRP8Q14114 963 aa13.21□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 NR0B2Q15466 257 aa13.21□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 TP53INP2Q8IXH6 220 aa13.21□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 SPPL3Q8TCT6 385 aa13.21□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa13.21□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 M0R233 179 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 RTCAO00442 366 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 FBP2O00757 339 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 PLD2O14939 933 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 CBLP22681 906 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 SHC2P98077 582 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 PMS2P3Q13401 168 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 GRIN2CQ14957 1233 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 ZNF773Q6PK81 442 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 HSDL2Q6YN16 418 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 IGDCC3Q8IVU1 814 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 HORMAD2Q8N7B1 307 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 OR8K5Q8NH50 307 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 ACTL7AQ9Y615 435 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 A0A1W2PP18 115 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 OR52A4PA6NMU1 304 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 OR7A10O76100 309 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 RPP14O95059 124 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 HSD3B1P14060 373 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 HSD3B2P26439 372 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 TIFABQ6ZNK6 161 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 NUP43Q8NFH3 380 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 VN1R2Q8NFZ6 395 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 EDAQ92838 391 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 NXPE3Q969Y0 559 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 LGR4Q9BXB1 951 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 SEC14L5O43304 696 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 CDRT1O95170 752 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 GSTT2P0CG29 244 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 CD1DP15813 335 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 CDKN3Q16667 212 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 ZNF100Q8IYN0 542 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 OR2L2Q8NH16 312 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 ISOC1Q96CN7 298 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 TMEM246Q9BRR3 403 aa13.2□□□□□ -0.3
USP22-201ENST00000261497 ZNF700Q9H0M5 742 aa13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms