RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 ARHGAP33O14559 1287 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 ENTPD6O75354 484 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 H1F0P07305 194 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 CCR8P51685 355 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 DGKEP52429 567 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 RHAGQ02094 409 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 NUDT13Q86X67 352 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 CXorf40AQ8TE69 158 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 POF1BQ8WVV4 589 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 SMPDL3AQ92484 453 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 NUAK2Q9H093 628 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 KLHL25Q9H0H3 589 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 FZD3Q9NPG1 666 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 WASH6PQ9NQA3 447 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 NDOR1Q9UHB4 597 aa15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HOXD3-201ENST00000249440 H3BN98 237 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 HMGN4O00479 90 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 HAT1O14929 419 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 ADRA2AP08913 450 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 EPCAMP16422 314 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 ETV6P41212 452 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 FRKP42685 505 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 GSTM5P46439 218 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 KCNJ5P48544 419 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 SMIM11AP58511 58 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 MESP2Q0VG99 397 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 CASP12Q6UXS9 341 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 HEATR4Q86WZ0 1026 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 KLHL6Q8WZ60 621 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 DHRS1Q96LJ7 313 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 TAPBPLQ9BX59 468 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 SACM1LQ9NTJ5 587 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 QPCTLQ9NXS2 382 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.58■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 SNX4O95219 450 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 DLGAP3O95886 979 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 SCG5P05408 212 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 ALOX12P18054 663 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 SEC23BQ15437 767 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF697Q5TEC3 545 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 SLX4IPQ5VYV7 408 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 DEF8Q6ZN54 512 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 RGMAQ96B86 450 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 COX14Q96I36 57 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 SEMA3GQ9NS98 782 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 C5AR2Q9P296 337 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 WDR37Q9Y2I8 494 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 FEZF1A0PJY2 475 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 ANHXE9PGG2 379 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 H7BY64 318 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 SEMA7AO75326 666 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 SOX14O95416 240 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 CCT3P49368 545 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 XKP51811 444 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 TP53BP2Q13625 1128 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 NCF4Q15080 339 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 SSX1Q16384 188 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 TMEM201Q5SNT2 666 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 DENND4AQ7Z401 1863 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 LRRTM4Q86VH4 590 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 CLIP4Q8N3C7 705 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 PLA2G15Q8NCC3 412 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 TMEM80Q96HE8 168 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 RACGAP1Q9H0H5 632 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 DEC1Q9P2X7 70 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 SLC23A2Q9UGH3 650 aa15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 DNTTP04053 509 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 CTNNB1P35222 781 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 FEN1P39748 380 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 SLC6A11P48066 632 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 DEFA1P59665 94 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 DEFA3P59666 94 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 OR8J1Q8NGP2 316 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 ABHD8Q96I13 439 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 OPALINQ96PE5 141 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 NT5DC2Q9H857 520 aa15.56■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
HOXD3-201ENST00000249440 P2RX2Q9UBL9 471 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms