RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PGLS	O95336	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FGF13	Q92913	245 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SCLY	Q96I15	445 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	QRSL1	Q9H0R6	528 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FAM166B	A8MTA8	275 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751		H0YGN5	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FBP2	O00757	339 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CSTA	P01040	98 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SPP1	P10451	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	EDN3	P14138	238 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	GRK5	P34947	590 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	DCAF7	P61962	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	GRM7	Q14831	915 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	GPR152	Q8TDT2	470 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751		A0A1W2PRU2	124 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751		A8MVJ9	347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FSCN2	O14926	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ADAM11	O75078	769 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CBR3	O75828	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CD38	P28907	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	GPC1	P35052	558 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SOX18	P35713	384 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SLC1A3	P43003	542 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	GPR85	P60893	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	LSAMP	Q13449	338 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PPA1	Q15181	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	WDR59	Q6PJI9	974 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PGAP1	Q75T13	922 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FBXL6	Q8N531	539 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FAM122A	Q96E09	287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CERS2	Q96G23	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RNF170	Q96K19	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751		A0A1W2PPL8	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	LRRTM2	O43300	516 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	RNF13	O43567	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ABCB7	O75027	752 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	SLC25A12	O75746	678 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FABP1	P07148	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	CCR4	P51679	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	MAP2K6	P52564	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	FOXK1	P85037	733 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TCF4-280	ENST00000636751	IQCK	Q8N0W5	287 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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