RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	HTR4	Q13639	388 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SYTL3	Q4VX76	610 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	FAHD1	Q6P587	224 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	DNASE1L2	Q92874	299 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	REPS1	Q96D71	796 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	STUB1	Q9UNE7	303 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659		U3KQV3	271 aa		14.61	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659		K7ESM1	405 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PIK3CG	P48736	1102 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RORC	P51449	518 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	IL1RL1	Q01638	556 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	IRF3	Q14653	427 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TAB1	Q15750	504 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CST6	Q15828	149 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PLET1	Q6UQ28	207 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PGBD3	Q8N328	593 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	STX19	Q8N4C7	294 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM159	Q96B96	161 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM202	A6NGA9	273 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ANHX	E9PGG2	379 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659		K7EQS6	105 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MID1	O15344	667 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	WDR47	O94967	919 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	IFNA16	P05015	189 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	EPB42	P16452	691 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CHM	P24386	653 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	DRD3	P35462	400 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	HNMT	P50135	292 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	AP1S2	P56377	157 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PSPH	P78330	225 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	DENND6B	Q8NEG7	585 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	OR2T11	Q8NH01	316 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	TM9SF2	Q99805	663 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	NTMT1	Q9BV86	223 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SLC32A1	Q9H598	525 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		14.6	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SLC22A5	O76082	557 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ADH1B	P00325	375 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	DNTT	P04053	509 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PRKACA	P17612	351 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	C5AR1	P21730	350 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	GRK5	P34947	590 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	GGT2	P36268	569 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SEC13	P55735	322 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RGS1	Q08116	209 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA0040	Q15053	153 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	GPR19	Q15760	415 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	ITCH	Q96J02	903 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	OR2AG1	Q9H205	316 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MMP28	Q9H239	520 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PPA2	Q9H2U2	334 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RASSF1	Q9NS23	344 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CMAHP	Q9Y471	501 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CDH23	Q9H251	3354 aa		14.59	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	RGS5	O15539	181 aa		14.58	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	HCN1	O60741	890 aa		14.58	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	CYP7B1	O75881	506 aa		14.58	□□□□□ -0.07
BBS1-225	ENST00000630659	FABP3	P05413	133 aa		14.58	□□□□□ -0.07

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