RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 LRFN4Q6PJG9 635 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 RNF111Q6ZNA4 994 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 NPAS3Q8IXF0 933 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 NEIL3Q8TAT5 605 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ARL11Q969Q4 196 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 NTAN1Q96AB6 310 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 KLHDC7BQ96G42 594 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 LRFN5Q96NI6 719 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF599Q96NL3 588 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OSBPL7Q9BZF2 842 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 KLHL42Q9P2K6 505 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 POMPQ9Y244 141 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SMIM30A4D0T7 59 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 VSTM2BA6NLU5 285 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CD300LBA8K4G0 201 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 F8W036 122 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 STMND1H3BQB6 276 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 MAP2K7O14733 419 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 B4GALT4O60513 344 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CSTAP01040 98 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CHRNA1P02708 482 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 UCHL1P09936 223 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ADORA3P0DMS8 318 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF30P17039 623 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CHRNB2P17787 502 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 IMPDH1P20839 514 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 MAOAP21397 527 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SHMT2P34897 504 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PREPP48147 710 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PITPNBP48739 271 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 P2RX1P51575 399 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PPP5CP53041 499 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 MLLT10P55197 1068 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OR4D2P58180 307 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ACTBP60709 375 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 NCS1P62166 190 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ACTG1P63261 375 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 BLOC1S1P78537 153 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF45Q02386 682 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM198Q66K66 360 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TPGS2Q68CL5 300 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 FIGNL1Q6PIW4 674 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 USP51Q70EK9 711 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CREB3L2Q70SY1 520 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OR4N5Q8IXE1 308 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ZFP82Q8N141 532 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OR2T33Q8NG76 320 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OR4K14Q8NGD5 310 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OR5L2Q8NGL0 311 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 DPF1Q92782 380 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PYCR2Q96C36 320 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 DDIT4LQ96D03 193 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ASB9Q96DX5 294 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 LRIG1Q96JA1 1093 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 FN3KRPQ9HA64 309 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PPM1HQ9ULR3 514 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CROCC2H7BZ55 1655 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TULP4Q9NRJ4 1543 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 A0A1W2PPV4 95 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 LRRTM2O43300 516 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SEC14L5O43304 696 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 DUX1O43812 170 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SERPINE2P07093 398 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM225BP0DP42 221 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ELNP15502 786 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 KITLGP21583 273 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CHRNA4P43681 627 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CLCNKBP51801 687 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 HMGCS1Q01581 520 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF92Q03936 586 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 FPGSQ05932 587 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF423Q2M1K9 1284 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 MFSD5Q6N075 450 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CEACAM19Q7Z692 300 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PRR18Q8N4B5 295 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 GATSQ8NAP1 163 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 NDNFQ8TB73 568 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CPXM1Q96SM3 734 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM83CQ9BQN1 747 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CCDC106Q9BWC9 280 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa3.89□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 BCO2Q9BYV7 579 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms