RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SNX4	O95219	450 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	INHBA	P08476	426 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC19A1	P41440	591 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	GFER	P55789	205 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF45	Q02386	682 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CSHL1	Q14406	222 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNAB1	Q14722	419 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	LCN9	Q8WX39	176 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ARL5B	Q96KC2	179 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CNDP1	Q96KN2	507 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NIPAL2	Q9H841	368 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	POLE3	Q9NRF9	147 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	GLS2	Q9UI32	602 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		6.9	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OR6C74	A6NCV1	312 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495		E7ENX8	843 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	DLGAP1	O14490	977 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TOR1B	O14657	336 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GNB5	O14775	395 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	FLRT2	O43155	660 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	DFNA5	O60443	496 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	KATNA1	O75449	491 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNK5	O95279	499 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ALB	P02768	609 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	APOA4	P06727	396 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	HNF4A	P41235	474 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	DPT	Q07507	201 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR18	Q14330	331 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	LTB4R	Q15722	352 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	HES3	Q5TGS1	186 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	STK32C	Q86UX6	486 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PLD3	Q8IV08	490 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	METTL4	Q8N3J2	472 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MUL1	Q969V5	352 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	NXNL1	Q96CM4	212 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	APOL4	Q9BPW4	351 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	UCK2	Q9BZX2	261 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	COL4A2	P08572	1712 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	AIM2	O14862	343 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TBX1	O43435	398 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	IFI30	P13284	250 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	F3	P13726	295 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GABARAPL2	P60520	117 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CCL7	P80098	99 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	FAP	Q12884	760 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC9A5	Q14940	896 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	LGSN	Q5TDP6	509 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	CES4A	Q5XG92	561 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	BEND4	Q6ZU67	534 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	USP51	Q70EK9	711 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	NRROS	Q86YC3	692 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR150	Q8NGU9	434 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	NETO1	Q8TDF5	533 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	YIPF5	Q969M3	257 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	PHF21A	Q96BD5	680 aa		6.89	□□□□□ -1.31
LETMD1-238	ENST00000623495	MOCOS	Q96EN8	888 aa		6.89	□□□□□ -1.31

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