RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600719.5

RAB11B-204, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, human

TSL 4

Gene RAB11B, Length 532 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB11B-204	ENST00000600719	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	PCSK5	Q92824	1860 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719		A0A0G2JND7	137 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	SOCS6	O14544	535 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	TBX19	O60806	448 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	LDB3	O75112	727 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	GPR75	O95800	540 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	IGHE	P01854	428 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	FURIN	P09958	794 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	PCSK2	P16519	638 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	CLDN8	P56748	225 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	FOLH1	Q04609	750 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	C2orf80	Q0P641	193 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	SLC13A2	Q13183	592 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	NSDHL	Q15738	373 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ZNF681	Q96N22	645 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	C5AR2	Q9P296	337 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ZZEF1	O43149	2961 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719		A0A1W2PS29	197 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	GABRR3	A8MPY1	467 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	UBD	O15205	165 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	NKX2-8	O15522	239 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	IDO1	P14902	403 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ITPKB	P27987	946 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	PPP2R1B	P30154	601 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	BIK	Q13323	160 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	CEBPE	Q15744	281 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	GSTA3	Q16772	222 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	CPZ	Q66K79	652 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	NUDT8	Q8WV74	236 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	C10orf82	Q8WW14	230 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	MTERF3	Q96E29	417 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	EPN3	Q9H201	632 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	REEP4	Q9H6H4	257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	SCN2A	Q99250	2005 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719		E9PBE3	544 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	AKAP10	O43572	662 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	KLHL41	O60662	606 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	LRAT	O95237	230 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	PRPS1L1	P21108	318 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	OTX2	P32243	289 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ALDH9A1	P49189	494 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ARFIP2	P53365	341 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ID2	Q02363	134 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	SERTAD2	Q14140	314 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	MPEG1	Q2M385	716 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	SPATA21	Q7Z572	469 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	C8orf44	Q96CB5	159 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	MARK4	Q96L34	752 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	TEX37	Q96LM6	180 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	WDR70	Q9NW82	654 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	PSME2	Q9UL46	239 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RAB11B-204	ENST00000600719	ACACB	O00763	2458 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11B-204	ENST00000600719	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11B-204	ENST00000600719	SNX3	O60493	162 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11B-204	ENST00000600719	SLC35E2	P0CK97	266 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RAB11B-204	ENST00000600719	COX6A1	P12074	109 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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