RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 GRIN2CQ14957 1233 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 ARMCX4Q5H9R4 360 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 SPANXN2Q5MJ10 180 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 TPGS2Q68CL5 300 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 ERICH5Q6P6B1 374 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM220Q6QAJ8 160 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 GDPD4Q6W3E5 623 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF605Q86T29 641 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 PLCZ1Q86YW0 608 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 FAM9CQ8IZT9 166 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 LINC00518Q8N0U6 118 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 CPA6Q8N4T0 437 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 OR8J2Q8NGG1 315 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF675Q8TD23 568 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 TCEAL4Q96EI5 215 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 OR2A14Q96R47 310 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 OR5M11Q96RB7 305 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 CCM2Q9BSQ5 444 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 MMP28Q9H239 520 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 SPNS1Q9H2V7 528 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 B3GNT2Q9NY97 397 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 OR5K4A6NMS3 321 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 DSCR3O14972 297 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 POP4O95707 220 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 DOC2BQ14184 412 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 ZMYND11Q15326 602 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 CFAP206Q8IYR0 622 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 AMER2Q8N7J2 671 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 OR2A12Q8NGT7 310 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 ECHDC3Q96DC8 303 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 HRASLS5Q96KN8 279 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 IL17FQ96PD4 163 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 MCCC2Q9HCC0 563 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 SLC25A13Q9UJS0 675 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 MKLN1Q9UL63 735 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 KLHL20Q9Y2M5 609 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC88CQ9P219 2028 aa10.2□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 WDFY4Q6ZS81 3184 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 C1orf226A1L170 272 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 TGM5O43548 720 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 PRAMEF10O60809 474 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 OR2B3O76000 313 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 KLK1P06870 262 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 PTGER1P34995 402 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 CCR2P41597 374 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 AP1S2P56377 157 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 TAS2R50P59544 299 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 CXCR4P61073 352 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 C2orf80Q0P641 193 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 SCARB2Q14108 478 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 IRF3Q14653 427 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 SLC5A12Q1EHB4 618 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 PRSS53Q2L4Q9 553 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 ARMC4Q5T2S8 1044 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 LIPJQ5W064 366 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 SZRD1Q7Z422 152 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 UBE2J2Q8N2K1 259 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 DNAJC22Q8N4W6 341 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF558Q96NG5 402 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 LYSMD1Q96S90 227 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 C11orf16Q9NQ32 467 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 EVA1BQ9NVM1 165 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF226Q9NYT6 803 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 CIB4A0PJX0 185 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 RTCAO00442 366 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 SH3BP5O60239 455 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 LRG1P02750 347 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 CLEC2LP0C7M8 214 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 CKMT1AP12532 417 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 HNF4AP41235 474 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 SELENOWP63302 87 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 ELP6Q0PNE2 266 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 FADDQ13158 208 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 RAB33AQ14088 237 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 OLIG3Q7RTU3 272 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 COMMD6Q7Z4G1 85 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM48Q8IWZ4 208 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 UBASH3BQ8TF42 649 aa10.19□□□□□ -0.78
FCHO1-216ENST00000596536 HHIPQ96QV1 700 aa10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms