RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC17A7Q9P2U7 560 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC17A6Q9P2U8 582 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ABCD2Q9UBJ2 740 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SIX4Q9UIU6 781 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PADI1Q9ULC6 663 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TBC1D24Q9ULP9 559 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SCML1Q9UN30 329 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PKP3Q9Y446 797 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 BCL9O00512 1426 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 POGZQ7Z3K3 1410 aa2.91□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 CLUHO75153 1309 aa2.91□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF541Q9H0D2 1346 aa2.91□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA3Q08378 1498 aa2.9□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 FANCD2Q9BXW9 1451 aa2.9□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GW15 77 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PRG6 482 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 A6NL46 340 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGEF33A8MVX0 844 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 E9PAM4 449 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 ITGA10O75578 1167 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 SEC14L2O76054 403 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 OR2C1O95371 312 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 IFNA2P01563 188 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 PMPCAQ10713 525 aa2.9□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
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PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 FRMD7Q6ZUT3 714 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRM-204ENST00000577468 RNF44Q7L0R7 432 aa2.9□□□□□ -1.95
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