RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 DUPD1Q68J44 220 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 SLC15A4Q8N697 577 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 FAR2Q96K12 515 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF597Q96LX8 424 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TSNARE1Q96NA8 513 aa9.52□□□□□ -0.89
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CTDNEP1-202ENST00000570380 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 QRFPRQ96P65 431 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCDC68Q9H2F9 335 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 PIGMQ9H3S5 423 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 AMFRQ9UKV5 643 aa9.52□□□□□ -0.89
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CTDNEP1-202ENST00000570380 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 IKBKGQ9Y6K9 419 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.52□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 A8MV72 311 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 ERI3O43414 337 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 LIASO43766 372 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 B3GALT2O43825 422 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 LDB3O75112 727 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TNFSF13O75888 250 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 MBD3O95983 291 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 FBXO45P0C2W1 286 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 CYP4B1P13584 511 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 NAGLUP54802 743 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 DIO3P55073 304 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 LIM2P55344 173 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 STX4Q12846 297 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 EIPR1Q53HC9 387 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 FNDC7Q5VTL7 733 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF470Q6ECI4 717 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 UGT3A1Q6NUS8 523 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 C22orf34Q6ZV56 151 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 GCNT2Q8N0V5 402 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 GNRHR2Q96P88 292 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 TM9SF2Q99805 663 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 MED18Q9BUE0 208 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 RBSNQ9H1K0 784 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.51□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 PELI2Q9HAT8 420 aa9.51□□□□□ -0.89
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CTDNEP1-202ENST00000570380 COPS7AQ9UBW8 275 aa9.51□□□□□ -0.89
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CTDNEP1-202ENST00000570380 LRIT2A6NDA9 550 aa9.5□□□□□ -0.89
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CTDNEP1-202ENST00000570380 MSTNO14793 375 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 IGKV3-11P04433 115 aa9.5□□□□□ -0.89
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CTDNEP1-202ENST00000570380 TPM1P09493 284 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 HIST1H2ADP20671 130 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 SERPINB3P29508 390 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 CCKARP32238 428 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 PCYT1AP49585 367 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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CTDNEP1-202ENST00000570380 SP140Q13342 867 aa9.5□□□□□ -0.89
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ZNF550Q7Z398 422 aa9.5□□□□□ -0.89
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CTDNEP1-202ENST00000570380 KIAA1328Q86T90 577 aa9.5□□□□□ -0.89
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CTDNEP1-202ENST00000570380 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 ARL15Q9NXU5 204 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 PAK5Q9P286 719 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 C15orf41Q9Y2V0 281 aa9.5□□□□□ -0.89
CTDNEP1-202ENST00000570380 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.49□□□□□ -0.89
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