RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HAVCR1	Q96D42	359 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C8orf76	Q96K31	380 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	APOLD1	Q96LR9	279 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C12orf66	Q96MD2	445 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RAB40C	Q96S21	281 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OMD	Q99983	421 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NTMT1	Q9BV86	223 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NUP58	Q9BVL2	599 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRY4	Q9C004	299 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MED20	Q9H944	212 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MARCH7	Q9H992	704 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PARVG	Q9HBI0	331 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SGK2	Q9HBY8	427 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NEK6	Q9HC98	313 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	EXOC1	Q9NV70	894 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZMYM6	O95789	1325 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	IL16	Q14005	1332 aa		2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0J9YYE9	177 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF222	A6NCQ9	220 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957		K7ERQ8	282 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ARPC3	O15145	178 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGEF9	O43307	516 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX3	O60493	162 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF254	O75437	659 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CLN5	O75503	358 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GRAP2	O75791	330 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CLDN7	O95471	211 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SYNGR4	O95473	234 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LGI1	O95970	557 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TRBC1	P01850	177 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PROS1	P07225	676 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC172	P0C7W6	258 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	STAG3L1	P0CL83	205 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVK-10	P10266	1014 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FCGR1A	P12314	374 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CEACAM1	P13688	526 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ANPEP	P15144	967 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GNS	P15586	552 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	AMD1	P17707	334 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HNF1A	P20823	631 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MSR1	P21757	451 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMA2	P25787	234 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1D2	P34982	312 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PTGFR	P43088	359 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH3B1	P43353	468 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP3CC	P48454	512 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	VEGFC	P49767	419 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CNTN2	Q02246	1040 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC20A2	Q08357	652 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NME3	Q13232	169 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ENPP2	Q13822	863 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF284	Q2VY69	593 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	AGK	Q53H12	422 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRC66	Q68CR7	880 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FUT10	Q6P4F1	479 aa		2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		2.56	□□□□□ -2

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