RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 FOPNLQ96NB1 174 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 SLC30A3Q99726 388 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 NPAS2Q99743 824 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 TRMOQ9BU70 441 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 MECRQ9BV79 373 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 ACAT2Q9BWD1 397 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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SMAD3-215ENST00000560424 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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SMAD3-215ENST00000560424 H7C1Q1 480 aa8.67□□□□□ -1.02
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SMAD3-215ENST00000560424 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
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SMAD3-215ENST00000560424 Q5PR19 223 aa8.67□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 CGB2Q6NT52 195 aa8.67□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 CYHR1Q6ZMK1 362 aa8.67□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 SPATA21Q7Z572 469 aa8.67□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 OR52N2Q8NGI0 321 aa8.67□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 C16orf52Q8NHV5 167 aa8.67□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 SCYL1Q96KG9 808 aa8.67□□□□□ -1.02
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SMAD3-215ENST00000560424 BDH2Q9BUT1 245 aa8.67□□□□□ -1.02
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SMAD3-215ENST00000560424 SLC1A6P48664 564 aa8.66□□□□□ -1.02
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SMAD3-215ENST00000560424 HERVK_113P63132 956 aa8.66□□□□□ -1.02
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SMAD3-215ENST00000560424 OR4D1Q15615 310 aa8.66□□□□□ -1.02
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SMAD3-215ENST00000560424 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SMAD3-215ENST00000560424 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8.66□□□□□ -1.02
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