RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544861.5

TDG-209, Transcript of thymine DNA glycosylase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TDG, Length 1,387 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDG-209ENST00000544861 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 CDK2AP1O14519 115 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 CELA3AP09093 270 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 AGAP20933 346 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 CRABP2P29373 138 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 PTGER4P35408 488 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 PIK3CGP48736 1102 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 RNF4P78317 190 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 SLAMF1Q13291 335 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 PFKFB4Q16877 469 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 EMC4Q5J8M3 183 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 MORN4Q8NDC4 146 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 OR5M9Q8NGP3 310 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 ZNF721Q8TF20 911 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 UCN3Q969E3 161 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 RUBCNLQ9H714 662 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 SNX15Q9NRS6 342 aa14.73□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 SPG11Q96JI7 2443 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 HIVEP1P15822 2718 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 GLOD5A6NK44 160 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 PLPP1O14494 284 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 SCELO95171 688 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 LRATO95237 230 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 C2P06681 752 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 CCL3P10147 92 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 PHBP35232 272 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 DNASE1L1P49184 302 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 RAP1GDS1P52306 607 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 ASPHQ12797 758 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 RCN2Q14257 317 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 TMEM35AQ53FP2 167 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 ZNF358Q9NW07 568 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 ACOT9Q9Y305 439 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.72□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa14.71□□□□□ -0.05
TDG-209ENST00000544861 A0A1W2PS29 197 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 NPIPA2E9PIF3 369 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 NPIPA3F8WFD2 350 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 GFAPP14136 432 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 EPB42P16452 691 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 FOLH1Q04609 750 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 SERTAD2Q14140 314 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 SETDB1Q15047 1291 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 CHSY3Q70JA7 882 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 DGAT2Q96PD7 388 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 UCK2Q9BZX2 261 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 PNPLA3Q9NST1 481 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 NFU1Q9UMS0 254 aa14.71□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 TMPRSS11DO60235 418 aa14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 GLSO94925 669 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 ACSL3O95573 720 aa14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 GBAP04062 536 aa14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 PIGAP37287 484 aa14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 MAGEA5P43359 124 aa14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 STT3AP46977 705 aa14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 NEK2P51955 445 aa14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 TNFRSF17Q02223 184 aa14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 RTL4Q6ZR62 310 aa14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 UBE2E3Q969T4 207 aa14.7□□□□□ -0.06
TDG-209ENST00000544861 RGMAQ96B86 450 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms