RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A1W2PR48 441 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 STX16O14662 325 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 PROM1O43490 865 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 KRT38O76015 456 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 CLDN9O95484 217 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 MLYCDO95822 493 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 IGKV3-11P04433 115 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 CUL3Q13618 768 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 IL20RBQ6UXL0 311 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 REPS1Q96D71 796 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 CENPKQ9BS16 269 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 PHF11Q9UIL8 331 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.2■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 GLOD5A6NK44 160 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 A8MVJ9 347 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP6CO00743 305 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 HS6ST1O60243 411 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 GBAP04062 536 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 COL6A2P12110 1019 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ARFIP1P53367 373 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 CDSNQ15517 529 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 CMPK2Q5EBM0 449 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 TAOK1Q7L7X3 1001 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 MRGPRGQ86SM5 289 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 GHDCQ8N2G8 530 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 POGLUT1Q8NBL1 392 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 PSD4Q8NDX1 1056 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 OR8K3Q8NH51 312 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 C16orf52Q8NHV5 167 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ASB15Q8WXK1 588 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 TANKQ92844 425 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 DGAT2Q96PD7 388 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 HPF1Q9NWY4 346 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 MS4A12Q9NXJ0 267 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ERVK-11Q9UQG0 969 aa22.19■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 A0A1W2PS29 197 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 PRSS44E7EML9 344 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 AIFM1O95831 613 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 RPS17P08708 135 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 CNTFP26441 200 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 PHEXP78562 749 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF750Q32MQ0 723 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 C9orf40Q8IXQ3 194 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 PHF12Q96QT6 1004 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 NTMT1Q9BV86 223 aa22.18■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 G3V3Y1 287 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ADAM10O14672 748 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 TFECO14948 347 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 SMIM24O75264 130 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 TUBB4AP04350 444 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ABHD2P08910 425 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM153BP0C7A2 387 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 TSPAN8P19075 237 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 CCNG1P51959 295 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 CASP6P55212 293 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ART3Q13508 389 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 FAM153CQ494X1 144 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 FRG2Q64ET8 278 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 C3P1Q6ZMU1 363 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 DOLPP1Q86YN1 238 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF18AQ8NI77 898 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP6V1E2Q96A05 226 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 FRG2BQ96QU4 278 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 TMCO1Q9UM00 188 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 PPT2Q9UMR5 302 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ENTPD4Q9Y227 616 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 MEMO1Q9Y316 297 aa22.17■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGAP10A1A4S6 786 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 A8MT66 165 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 GPR75O95800 540 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 NR2F6P10588 404 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 PRF1P14222 555 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 ABOP16442 354 aa22.16■■□□□ 1.14
PACSIN3-204ENST00000528201 CDH13P55290 713 aa22.16■■□□□ 1.14
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