RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526151.5

PUF60-206, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 3

Gene PUF60, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-206	ENST00000526151	VPS4A	Q9UN37	437 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	DSCR3	O14972	297 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ZNF749	O43361	778 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	RDH16	O75452	317 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	C1QC	P02747	245 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ATP1B1	P05026	303 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	FGF5	P12034	268 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	CPN2	P22792	545 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	RORA	P35398	523 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	SEPHS1	P49903	392 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ARSF	P54793	590 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	LIPE	Q05469	1076 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	SPEM2	Q0P670	501 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	FADD	Q13158	208 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	TANK	Q92844	425 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	FANCE	Q9HB96	536 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ADA2	Q9NZK5	511 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	SPEG	Q15772	3267 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	SGK494	L7N484	410 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	CLIC1	O00299	241 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	PLOD2	O00469	737 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	CHST10	O43529	356 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	B4GALT2	O60909	372 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	TNFRSF21	O75509	655 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	CIB2	O75838	187 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	PSMG1	O95456	288 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	UQCRC2	P22695	453 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	NTS	P30990	170 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	LIMK1	P53667	647 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	SHC2	P98077	582 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	DSG2	Q14126	1118 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ADRM1	Q16186	407 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	PTOV1	Q86YD1	416 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	SHISA5	Q8N114	240 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ZNF675	Q8TD23	568 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	OR1F2P	Q96R84	312 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	CDC6	Q99741	560 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	LANCL2	Q9NS86	450 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	SPACA6	W5XKT8	324 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151		A0A1B0GX78	115 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151		A0A1W2PS29	197 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	AQP12B	A6NM10	295 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151		H0YHG0	523 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	FGF17	O60258	216 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ENTPD5	O75356	428 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	GSN	P06396	782 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	GGT1	P19440	569 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	ATP6V1B2	P21281	511 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	IL10	P22301	178 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	PPP2R1B	P30154	601 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PUF60-206	ENST00000526151	GALNS	P34059	522 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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